More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0111 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  100 
 
 
464 aa  934    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  42.44 
 
 
452 aa  376  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  39.63 
 
 
455 aa  314  2.9999999999999996e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  36.09 
 
 
455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  30.21 
 
 
452 aa  227  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  30.52 
 
 
439 aa  226  7e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  32.33 
 
 
456 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  32.82 
 
 
455 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  32.82 
 
 
455 aa  206  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  32.6 
 
 
477 aa  203  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  33.03 
 
 
456 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  31.71 
 
 
447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  32.02 
 
 
462 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  31.09 
 
 
449 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  30.56 
 
 
447 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  29.58 
 
 
455 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  33.64 
 
 
447 aa  189  7e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  29.98 
 
 
460 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  30.61 
 
 
454 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  29.06 
 
 
464 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  29.08 
 
 
454 aa  176  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  29.64 
 
 
461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  30.34 
 
 
440 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  31.22 
 
 
455 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  30.6 
 
 
455 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  29.71 
 
 
452 aa  170  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  29.67 
 
 
451 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  29.93 
 
 
448 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  29.27 
 
 
451 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  29.67 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  30.3 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  31.51 
 
 
449 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  29.44 
 
 
451 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  30.07 
 
 
451 aa  167  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  28.47 
 
 
442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  30.3 
 
 
451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  30.3 
 
 
451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  29.44 
 
 
451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  28.77 
 
 
454 aa  164  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
454 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  29.3 
 
 
456 aa  160  5e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  28.38 
 
 
452 aa  159  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  28.05 
 
 
461 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  28.51 
 
 
496 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  29.75 
 
 
451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  28.31 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.47 
 
 
448 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  28.74 
 
 
451 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  28.74 
 
 
451 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  23.84 
 
 
454 aa  151  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  27.64 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  27.93 
 
 
460 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  28.04 
 
 
452 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  25.99 
 
 
451 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  28.12 
 
 
459 aa  145  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.85 
 
 
461 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  27.02 
 
 
451 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  28.08 
 
 
460 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  27.03 
 
 
466 aa  144  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  27.98 
 
 
445 aa  144  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  25 
 
 
460 aa  143  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  26.43 
 
 
451 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  27.74 
 
 
496 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  26.57 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  27.39 
 
 
447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  25.72 
 
 
450 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  26.48 
 
 
451 aa  139  8.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
450 aa  137  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  26.07 
 
 
457 aa  136  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  27.64 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  25.83 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  27.59 
 
 
489 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  24.78 
 
 
472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  25.17 
 
 
451 aa  133  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  24.15 
 
 
518 aa  133  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.05 
 
 
454 aa  133  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  27.76 
 
 
458 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  24.71 
 
 
453 aa  132  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
442 aa  132  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  24.58 
 
 
472 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1918  MATE efflux family protein  25.38 
 
 
501 aa  131  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  28.04 
 
 
451 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  27.8 
 
 
451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  27.8 
 
 
451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  25.53 
 
 
459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
498 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1699  MATE efflux family protein  24.74 
 
 
520 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  26.78 
 
 
459 aa  130  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1698  MATE efflux family protein  24.74 
 
 
517 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1623  MATE efflux family protein  24.74 
 
 
520 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.04 
 
 
451 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.88 
 
 
468 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  25.88 
 
 
460 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  27.73 
 
 
448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  25.94 
 
 
462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  27.29 
 
 
467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  27.73 
 
 
450 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.35 
 
 
490 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  25.24 
 
 
486 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>