More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0061 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0061  glutamate racemase  100 
 
 		 275 aa  546  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.21676e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  40.39 
 
 		 267 aa  195  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  41.04 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  37.97 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  38.08 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  36.68 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  36.68 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  34.73 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  35.83 
 
 		 270 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  37.95 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  35.15 
 
 		 276 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  40.97 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  34.76 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  34.47 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  31.91 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  31.25 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  34.48 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  33.96 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  35.96 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  35.32 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  37.28 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  36.96 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  36.56 
 
 		 284 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  35.53 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0429  glutamate racemase  36.19 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.13208  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  33.46 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  36.68 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1865  glutamate racemase  30.94 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0131897  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  33.48 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  32.41 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2624  glutamate racemase  38.46 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  33.88 
 
 		 271 aa  156  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  34.68 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  35.57 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  35.57 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  35.94 
 
 		 267 aa  155  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  35.09 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  32.03 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  32.9 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  32.18 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  30.47 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  30.22 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  33.62 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  35.93 
 
 		 291 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  33.33 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  35.39 
 
 		 260 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  30.74 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  30.08 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  34.39 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  32.26 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  31.14 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  37.5 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  31.14 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3460  glutamate racemase  33.95 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0361413 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  32.16 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  33.91 
 
 		 281 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  35.65 
 
 		 273 aa  149  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  33.91 
 
 		 281 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  32.59 
 
 		 270 aa  148  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  34.84 
 
 		 270 aa  148  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  34.06 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0079  glutamate racemase  35.94 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  30.26 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  28.91 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  29.71 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  33.33 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  31.13 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  28.79 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3867  glutamate racemase  32.63 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  33.04 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0705  glutamate racemase  31.82 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000505847 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0680  glutamate racemase  32.45 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  30 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  33.2 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  34.38 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  34.38 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  33.19 
 
 		 271 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  33.04 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0054  glutamate racemase  32.82 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.382436  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  38.89 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  29.92 
 
 		 270 aa  142  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0733  glutamate racemase  35.84 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1209  glutamate racemase  35.4 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1231  glutamate racemase  35.4 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.759515  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  27.27 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  30.6 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6531  glutamate racemase  33.95 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.161273 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  26.72 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  28.79 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1752  glutamate racemase  26.56 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  33.17 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2377  glutamate racemase  32.59 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.65613 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  31.69 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0989  glutamate racemase  40.09 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.84456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  33.86 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  28.74 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  33.33 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  34 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  34.38 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  36.36 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>