More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0052 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2110  dihydroxy-acid dehydratase  57.79 
 
 
560 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  63 
 
 
552 aa  712    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  59.42 
 
 
556 aa  679    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  64.86 
 
 
552 aa  739    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0589  dihydroxy-acid dehydratase  60.8 
 
 
554 aa  691    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000577484  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  56.5 
 
 
555 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  58.7 
 
 
552 aa  680    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  66.85 
 
 
554 aa  770    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0009  dihydroxy-acid dehydratase  58.05 
 
 
556 aa  659    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.961342  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2034  dihydroxy-acid dehydratase  56.47 
 
 
555 aa  643    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  64.86 
 
 
557 aa  720    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10820  dihydroxy-acid dehydratase  60.73 
 
 
551 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1755  dihydroxy-acid dehydratase  60.22 
 
 
558 aa  682    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2147  dihydroxy-acid dehydratase  59.31 
 
 
553 aa  682    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0018  dihydroxy-acid dehydratase  64.2 
 
 
559 aa  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0356  dihydroxy-acid dehydratase  58.33 
 
 
557 aa  651    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0280  dihydroxy-acid dehydratase  60.36 
 
 
554 aa  694    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.141574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  57.32 
 
 
556 aa  640    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2036  dihydroxy-acid dehydratase  59.71 
 
 
557 aa  669    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000199143  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0024  dihydroxy-acid dehydratase  56.42 
 
 
554 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0052  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 
560 aa  1130    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00527668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0222  dihydroxy-acid dehydratase  59.17 
 
 
553 aa  662    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.385922  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0102  dihydroxy-acid dehydratase  55.35 
 
 
552 aa  634  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0234635  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_738  dihydroxy-acid dehydratase  56.65 
 
 
555 aa  631  1e-179  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000109399  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1275  dihydroxy-acid dehydratase  57.61 
 
 
557 aa  624  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.208811  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0753  dihydroxy-acid dehydratase  56.12 
 
 
555 aa  623  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0834  dihydroxy-acid dehydratase  56.12 
 
 
555 aa  617  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00030605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2014  dihydroxy-acid dehydratase  55.96 
 
 
558 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0410747  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0369  dihydroxy-acid dehydratase  54.53 
 
 
554 aa  609  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2871  dihydroxy-acid dehydratase  55.6 
 
 
559 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0386  dihydroxy-acid dehydratase  54.35 
 
 
554 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2481  dihydroxy-acid dehydratase  54.56 
 
 
563 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00604257  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0217  dihydroxy-acid dehydratase  54.43 
 
 
554 aa  604  1.0000000000000001e-171  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0744  dihydroxy-acid dehydratase  53.14 
 
 
566 aa  601  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.217755 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08860  dihydroxyacid dehydratase  53.08 
 
 
552 aa  588  1e-167  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.131951  normal  0.204216 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1614  dihydroxy-acid dehydratase  54.56 
 
 
556 aa  590  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1446  dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 
557 aa  590  1e-167  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1937  dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 
557 aa  586  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0680  dihydroxy-acid dehydratase  54.14 
 
 
550 aa  585  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1969  dihydroxy-acid dehydratase  52.25 
 
 
557 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1891  dihydroxy-acid dehydratase  51.71 
 
 
557 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1854  dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 
557 aa  586  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3488  dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 
557 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1710  dihydroxy-acid dehydratase  51.89 
 
 
557 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1717  dihydroxy-acid dehydratase  51.89 
 
 
557 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1694  dihydroxy-acid dehydratase  51.71 
 
 
557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1669  dihydroxy-acid dehydratase  51.89 
 
 
557 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1853  dihydroxy-acid dehydratase  51.89 
 
 
557 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2246  dihydroxy-acid dehydratase  52.07 
 
 
553 aa  580  1e-164  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.154532  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1906  dihydroxy-acid dehydratase  51.98 
 
 
559 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1329  dihydroxy-acid dehydratase  53.54 
 
 
550 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0742  dihydroxy-acid dehydratase  53.49 
 
 
565 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.853368  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1878  dihydroxy-acid dehydratase  51.71 
 
 
557 aa  572  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119972 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0540  dihydroxy-acid dehydratase  50.9 
 
 
569 aa  568  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0854  dihydroxy-acid dehydratase  52.42 
 
 
565 aa  570  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2167  dihydroxy-acid dehydratase  51.7 
 
 
565 aa  569  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2069  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 
553 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.297693  normal  0.926907 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0609  dihydroxy-acid dehydratase  52.06 
 
 
565 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1716  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 
579 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0300181 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2230  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 
557 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2040  dihydroxyacid dehydratase  50.53 
 
 
580 aa  562  1.0000000000000001e-159  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0805544  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1356  dihydroxy-acid dehydratase  53.78 
 
 
550 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1320  dihydroxy-acid dehydratase  52.99 
 
 
550 aa  560  1e-158  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1111  dihydroxy-acid dehydratase  49.55 
 
 
558 aa  556  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0633  dihydroxy-acid dehydratase  52.99 
 
 
550 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.435026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1665  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 
562 aa  545  1e-154  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.361875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4450  dihydroxy-acid dehydratase  48.75 
 
 
561 aa  548  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0129872  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0985  dihydroxy-acid dehydratase  49.64 
 
 
547 aa  546  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156151  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0673  dihydroxy-acid dehydratase  51.79 
 
 
548 aa  546  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1203  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 
550 aa  546  1e-154  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0134222 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0012  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 
558 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0139  dihydroxy-acid dehydratase  51.35 
 
 
550 aa  542  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0013  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 
558 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00657346  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1851  dihydroxy-acid dehydratase, truncated  49.64 
 
 
577 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.14511  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2127  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 
562 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2090  dihydroxy-acid dehydratase  48.83 
 
 
562 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362499  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1541  dihydroxy-acid dehydratase  50 
 
 
558 aa  533  1e-150  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0613  dihydroxy-acid dehydratase  49.36 
 
 
547 aa  530  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0041  dihydroxy-acid dehydratase  49.91 
 
 
559 aa  530  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0505  dihydroxy-acid dehydratase  48.47 
 
 
547 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1769  dihydroxy-acid dehydratase  50.45 
 
 
553 aa  526  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2559  dihydroxy-acid dehydratase  47.28 
 
 
553 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000124131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0039  dihydroxy-acid dehydratase  49.28 
 
 
558 aa  525  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00474435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3218  dihydroxy-acid dehydratase  49.02 
 
 
562 aa  519  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0012  dihydroxy-acid dehydratase  49.03 
 
 
582 aa  521  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2505  dihydroxy-acid dehydratase  48.28 
 
 
553 aa  521  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000116133  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0662  dihydroxy-acid dehydratase  48.66 
 
 
613 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.587488  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0811  dihydroxy-acid dehydratase  48.66 
 
 
558 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0065  dihydroxy-acid dehydratase  48.39 
 
 
561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000240463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4263  dihydroxy-acid dehydratase  47.66 
 
 
560 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4111  dihydroxy-acid dehydratase  47.12 
 
 
560 aa  515  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0132321  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4240  dihydroxy-acid dehydratase  47.48 
 
 
560 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2036  dihydroxy-acid dehydratase  48.3 
 
 
557 aa  508  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1911  dihydroxy-acid dehydratase  47.02 
 
 
556 aa  509  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1259  dihydroxy-acid dehydratase  47.56 
 
 
553 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000947046  hitchhiker  0.0000123711 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1752  dihydroxy-acid dehydratase  48.66 
 
 
557 aa  510  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1912  dihydroxy-acid dehydratase  45.75 
 
 
553 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.82927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4269  dihydroxy-acid dehydratase  46.94 
 
 
561 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34728  normal  0.47373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1494  dihydroxy-acid dehydratase  47.74 
 
 
553 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3418  dihydroxy-acid dehydratase  46.06 
 
 
620 aa  508  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>