More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0045 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 374 aa  744    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  38.56 
 
 		 370 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  39.36 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  39 
 
 		 369 aa  263  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  37.4 
 
 		 370 aa  257  2e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  34.32 
 
 		 402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  40.71 
 
 		 280 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  32.14 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  32.14 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  32.14 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  30.84 
 
 		 438 aa  199  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  29.63 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.69 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.69 
 
 		 398 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.69 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 367 aa  192  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 393 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.42 
 
 		 398 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.42 
 
 		 398 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  28.92 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  30.96 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  28.42 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  28.16 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  28.16 
 
 		 395 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  30.41 
 
 		 385 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 385 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.89 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  30.41 
 
 		 385 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 385 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 385 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  29.88 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  24.27 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  27.44 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  27.44 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  25.81 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  26.74 
 
 		 414 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.91 
 
 		 431 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.91 
 
 		 447 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.91 
 
 		 431 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.91 
 
 		 431 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.91 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 444 aa  175  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  28.65 
 
 		 411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  28.37 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  28.37 
 
 		 411 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  28.37 
 
 		 411 aa  172  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  28.09 
 
 		 411 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  28.09 
 
 		 411 aa  170  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  30.03 
 
 		 407 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 435 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  30.75 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  28.09 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  27.65 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 		 435 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  27.06 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 410 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 410 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.26 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.26 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  24.26 
 
 		 394 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.96 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  22.4 
 
 		 460 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  21.6 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 436 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 436 aa  96.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 436 aa  96.7  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 366 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  21.43 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  25.82 
 
 		 391 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  21.51 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 489 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  21.03 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 410 aa  89.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  20.12 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  21.18 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  20.35 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  19.88 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  19.67 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  20.9 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  19.28 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  22.18 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  20.41 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  21.37 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  21.02 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>