More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0024 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  100 
 
 		 846 aa  1742    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  37.04 
 
 		 843 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  36.91 
 
 		 840 aa  566  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  38.24 
 
 		 830 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  36.69 
 
 		 876 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  38 
 
 		 830 aa  558  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  36.34 
 
 		 838 aa  542  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  35.18 
 
 		 843 aa  535  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  34.71 
 
 		 851 aa  531  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  36.17 
 
 		 822 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  36.45 
 
 		 832 aa  487  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  33.98 
 
 		 709 aa  406  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.38 
 
 		 927 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.63 
 
 		 944 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  34.68 
 
 		 659 aa  383  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.89 
 
 		 960 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.99 
 
 		 956 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.61 
 
 		 921 aa  357  6.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  32 
 
 		 934 aa  356  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.99 
 
 		 957 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.55 
 
 		 952 aa  350  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  30.61 
 
 		 929 aa  344  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.96 
 
 		 921 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  31.01 
 
 		 636 aa  341  4e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  30.13 
 
 		 661 aa  341  4e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  32.29 
 
 		 651 aa  332  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  30.57 
 
 		 713 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  29.93 
 
 		 707 aa  320  6e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  30.67 
 
 		 643 aa  319  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  30.86 
 
 		 725 aa  318  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  30.5 
 
 		 729 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  28.51 
 
 		 668 aa  314  5.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  30.27 
 
 		 658 aa  312  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  31.41 
 
 		 667 aa  310  5e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  29.39 
 
 		 660 aa  310  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  29.2 
 
 		 640 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  30.37 
 
 		 639 aa  307  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.13 
 
 		 909 aa  299  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  29.12 
 
 		 646 aa  298  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  31.28 
 
 		 675 aa  298  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  28.8 
 
 		 635 aa  295  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  31.13 
 
 		 641 aa  293  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  28.73 
 
 		 754 aa  292  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  29.28 
 
 		 698 aa  290  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  30.66 
 
 		 681 aa  289  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  27.73 
 
 		 633 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  28.55 
 
 		 636 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  28.69 
 
 		 647 aa  287  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  27.02 
 
 		 670 aa  282  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  30.13 
 
 		 652 aa  282  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  29.22 
 
 		 636 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  28.94 
 
 		 636 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  29.22 
 
 		 636 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  29.22 
 
 		 636 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  29.22 
 
 		 636 aa  280  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  30.16 
 
 		 652 aa  280  8e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 929 aa  280  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  28.02 
 
 		 636 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  28.31 
 
 		 636 aa  278  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  28.31 
 
 		 636 aa  278  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  28.31 
 
 		 636 aa  278  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  28.31 
 
 		 636 aa  278  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  28.31 
 
 		 636 aa  278  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  28.31 
 
 		 636 aa  278  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  28.31 
 
 		 636 aa  278  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  28.02 
 
 		 646 aa  278  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  28.33 
 
 		 639 aa  277  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  28.09 
 
 		 653 aa  277  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.37 
 
 		 921 aa  275  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  28.17 
 
 		 636 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  28.92 
 
 		 664 aa  273  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.42 
 
 		 934 aa  272  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.42 
 
 		 934 aa  272  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  29.19 
 
 		 644 aa  270  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.24 
 
 		 966 aa  270  8.999999999999999e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.55 
 
 		 934 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.55 
 
 		 934 aa  269  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.66 
 
 		 934 aa  269  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.55 
 
 		 934 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.66 
 
 		 934 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27.14 
 
 		 934 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  27 
 
 		 934 aa  267  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.84 
 
 		 641 aa  266  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.8 
 
 		 934 aa  265  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2005  putative ATP-dependent DNA helicase-related protein  27.94 
 
 		 666 aa  262  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.349435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  29.29 
 
 		 649 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  25.49 
 
 		 668 aa  258  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4486  helicase c2  24.69 
 
 		 714 aa  252  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  25.3 
 
 		 685 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1900  helicase c2  27.37 
 
 		 688 aa  250  9e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.76 
 
 		 690 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.66 
 
 		 716 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.05 
 
 		 690 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  27 
 
 		 690 aa  245  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.23 
 
 		 690 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.45 
 
 		 690 aa  244  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.65 
 
 		 691 aa  243  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.82 
 
 		 690 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.39 
 
 		 690 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.39 
 
 		 690 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>