More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6145 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  100 
 
 
323 aa  627  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  87.93 
 
 
323 aa  554  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  90.71 
 
 
323 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  87 
 
 
323 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  90.71 
 
 
323 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6650  threonine dehydratase  89.47 
 
 
323 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.987033  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3864  threonine dehydratase  70.95 
 
 
330 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  71.7 
 
 
344 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2151  threonine dehydratase  72.47 
 
 
319 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.232832  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4430  threonine dehydratase  58.82 
 
 
330 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4376  ectoine utilization protein EutB  64.69 
 
 
325 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3469  threonine dehydratase  58.88 
 
 
324 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5519  threonine dehydratase  61.2 
 
 
333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0114285 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5240  threonine dehydratase  57.86 
 
 
333 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3695  threonine dehydratase  56.6 
 
 
334 aa  315  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme beta subunit  50.99 
 
 
324 aa  279  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2723  threonine dehydratase  56.58 
 
 
331 aa  267  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0285  threonine dehydratase  55.76 
 
 
318 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.832074  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  41.69 
 
 
405 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  43.61 
 
 
403 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3175  threonine dehydratase  57.09 
 
 
318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.465407  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  39.31 
 
 
403 aa  220  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  45.54 
 
 
415 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  39.49 
 
 
403 aa  217  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  39.23 
 
 
403 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  45.05 
 
 
402 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  38.26 
 
 
403 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  38.26 
 
 
403 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  45.14 
 
 
403 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  45.03 
 
 
403 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  37.58 
 
 
403 aa  205  9e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  43.79 
 
 
403 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  40.67 
 
 
514 aa  203  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  45.48 
 
 
410 aa  202  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  35.74 
 
 
404 aa  202  8e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  36.68 
 
 
402 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  43.87 
 
 
402 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  37.85 
 
 
402 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  41.67 
 
 
402 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  34.89 
 
 
402 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  45.69 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  37.9 
 
 
400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  39.69 
 
 
403 aa  196  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  40.33 
 
 
507 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  42.81 
 
 
403 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  43.69 
 
 
512 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  42.9 
 
 
506 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  42.9 
 
 
506 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  44.69 
 
 
404 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  33.96 
 
 
402 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  37.5 
 
 
408 aa  191  1e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.99 
 
 
332 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  40.4 
 
 
501 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.45 
 
 
315 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  39.4 
 
 
507 aa  190  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  36.31 
 
 
403 aa  189  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  40.79 
 
 
408 aa  189  5e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  36.56 
 
 
401 aa  187  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  40.61 
 
 
520 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  35.62 
 
 
401 aa  187  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  40.44 
 
 
401 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  40.44 
 
 
401 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  38.59 
 
 
333 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  38.59 
 
 
333 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  41.64 
 
 
412 aa  186  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  43.03 
 
 
406 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  38.01 
 
 
509 aa  185  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  36.52 
 
 
511 aa  185  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  38.26 
 
 
333 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  38.26 
 
 
333 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.87 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  41.51 
 
 
402 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  38.26 
 
 
333 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  39.27 
 
 
503 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  39.23 
 
 
400 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  39.86 
 
 
526 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  44.38 
 
 
412 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  38.26 
 
 
333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  41.31 
 
 
403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  40.25 
 
 
415 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  44.48 
 
 
421 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  39.13 
 
 
527 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  40.45 
 
 
403 aa  182  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  39.94 
 
 
399 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  42.81 
 
 
407 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  40.38 
 
 
402 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  42.77 
 
 
411 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  36.3 
 
 
395 aa  181  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  39.53 
 
 
504 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  39.53 
 
 
504 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  42.19 
 
 
411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  39.53 
 
 
510 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  39.73 
 
 
418 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  38.03 
 
 
549 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  36.68 
 
 
402 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  43.75 
 
 
403 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  39.62 
 
 
408 aa  179  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  43.05 
 
 
318 aa  179  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  37.94 
 
 
333 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  35.99 
 
 
514 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>