More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6034 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6034  porin  100 
 
 
382 aa  776    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  39.95 
 
 
366 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  39.95 
 
 
366 aa  230  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  37.53 
 
 
359 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  36.76 
 
 
357 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  37.26 
 
 
359 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  37.54 
 
 
496 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  36.76 
 
 
357 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  37.61 
 
 
362 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  37.61 
 
 
362 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  37.61 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  37.61 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  37.61 
 
 
383 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  37.61 
 
 
383 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  36.99 
 
 
362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  36.81 
 
 
357 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  37.75 
 
 
359 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  37.5 
 
 
368 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  36.99 
 
 
359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  35.2 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  35.62 
 
 
359 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  35.62 
 
 
359 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  34.7 
 
 
361 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  35.89 
 
 
359 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  37.09 
 
 
357 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  36.34 
 
 
379 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  36.34 
 
 
379 aa  189  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  35.71 
 
 
379 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  35.52 
 
 
379 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  35.52 
 
 
379 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  35.52 
 
 
379 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  35.81 
 
 
379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0260  outer membrane protein (porin)  38.57 
 
 
373 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  36.36 
 
 
481 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  36.36 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  36.36 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  36.36 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  36.36 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  36.36 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  36.36 
 
 
380 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  36.36 
 
 
380 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  35.03 
 
 
383 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  34.13 
 
 
371 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  35.47 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  35.88 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  34.4 
 
 
382 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  35.2 
 
 
382 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  35.45 
 
 
360 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  34.52 
 
 
383 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0916  OmpC family outer membrane porin  36.34 
 
 
365 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226254  normal  0.19283 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  33.25 
 
 
381 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  34.2 
 
 
367 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  32.48 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  32.23 
 
 
381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  34.68 
 
 
385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  35.03 
 
 
392 aa  166  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  34.43 
 
 
385 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  34.28 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0910  OmpC family outer membrane porin  34.84 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106458  normal  0.0412885 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  36.69 
 
 
366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  36.84 
 
 
366 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  36.84 
 
 
366 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  36.67 
 
 
388 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  33.08 
 
 
379 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  34.81 
 
 
384 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  37.21 
 
 
375 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  35.63 
 
 
383 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  34.89 
 
 
386 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  34.42 
 
 
378 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  33.16 
 
 
379 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  33.16 
 
 
379 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  33.16 
 
 
379 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  34.26 
 
 
389 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0072  porin Gram-negative type  34.26 
 
 
385 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  33.74 
 
 
400 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  34.18 
 
 
383 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  37.53 
 
 
375 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  34.18 
 
 
383 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  34.35 
 
 
383 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  37.53 
 
 
375 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  32.9 
 
 
379 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  33.5 
 
 
400 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  32.9 
 
 
379 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  32.83 
 
 
384 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  34.18 
 
 
383 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  33.66 
 
 
409 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  34.22 
 
 
375 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  34.06 
 
 
366 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  32.24 
 
 
379 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  35.52 
 
 
380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  35.85 
 
 
386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  32.56 
 
 
380 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  32.82 
 
 
383 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1102  outer membrane porin  33.51 
 
 
358 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  35.52 
 
 
380 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  33.16 
 
 
365 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  33.16 
 
 
365 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  33.16 
 
 
365 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  33.16 
 
 
365 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  34.55 
 
 
380 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>