More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6033 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  100 
 
 
467 aa  929    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  50.22 
 
 
449 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  48.42 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  48.42 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  52.02 
 
 
448 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  49.89 
 
 
449 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  47.89 
 
 
456 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  49.55 
 
 
447 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  49.88 
 
 
436 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  49.32 
 
 
447 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  49.32 
 
 
447 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  48.12 
 
 
450 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  49.41 
 
 
436 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  49.34 
 
 
479 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  50.71 
 
 
444 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  49.13 
 
 
469 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  52.51 
 
 
448 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  52.51 
 
 
448 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  52.51 
 
 
448 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  52.51 
 
 
448 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  48.91 
 
 
461 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  52.51 
 
 
448 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  49.45 
 
 
464 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  48 
 
 
455 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  52.51 
 
 
448 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  52.51 
 
 
448 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  46.76 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  48.58 
 
 
458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  47.87 
 
 
478 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  48.58 
 
 
463 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2344  major facilitator transporter  46.79 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  48.37 
 
 
463 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  48.37 
 
 
463 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  47.02 
 
 
449 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  44.87 
 
 
438 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  46.17 
 
 
429 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 
442 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  40.53 
 
 
454 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4548  MFS transporter, phthalate permease family  41.18 
 
 
461 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0771862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  41.4 
 
 
454 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  40.53 
 
 
454 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  45.41 
 
 
430 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  41.99 
 
 
463 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  44.94 
 
 
430 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  45.56 
 
 
432 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  44.94 
 
 
430 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  41.31 
 
 
461 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  45.56 
 
 
432 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  44.94 
 
 
445 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  44.94 
 
 
445 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  42.5 
 
 
450 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  44.71 
 
 
430 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  42.5 
 
 
450 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  41.22 
 
 
468 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  45.33 
 
 
432 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  42.5 
 
 
450 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  42.5 
 
 
450 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  42.5 
 
 
450 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  44.71 
 
 
430 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  42.79 
 
 
440 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  40.68 
 
 
453 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  42.5 
 
 
450 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  44.5 
 
 
428 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  44.71 
 
 
430 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  42.27 
 
 
450 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  41.32 
 
 
451 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  42.24 
 
 
450 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  44.24 
 
 
428 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  44.24 
 
 
428 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  46.17 
 
 
430 aa  363  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  44.02 
 
 
413 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  41.19 
 
 
452 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  41 
 
 
450 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  41.19 
 
 
452 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  41.19 
 
 
450 aa  362  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  41.19 
 
 
452 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  41.19 
 
 
452 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  42.11 
 
 
454 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  41.19 
 
 
452 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  42.01 
 
 
445 aa  358  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  40.13 
 
 
450 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  41.47 
 
 
453 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  41.88 
 
 
454 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  41.88 
 
 
454 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  41.44 
 
 
451 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  41.56 
 
 
451 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  41.19 
 
 
450 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  40.73 
 
 
454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  45.48 
 
 
430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  39.73 
 
 
458 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  41.78 
 
 
438 aa  353  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  40.69 
 
 
466 aa  352  8e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  40.85 
 
 
447 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  41.61 
 
 
446 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  41.61 
 
 
446 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  40.51 
 
 
455 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0841  d-galactonate transporter  39.77 
 
 
450 aa  346  6e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  41.01 
 
 
450 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  41.01 
 
 
450 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  41.16 
 
 
453 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>