More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6016 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6579  amino acid permease-associated region  82.51 
 
 
462 aa  751    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0989749  decreased coverage  0.00384925 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6016  amino acid permease-associated region  100 
 
 
463 aa  916    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5856  amino acid permease-associated region  82.29 
 
 
463 aa  738    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7548  amino acid transporter  82.07 
 
 
463 aa  751    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219639 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5732  amino acid permease-associated region  82.07 
 
 
462 aa  751    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6094  amino acid permease-associated region  81.86 
 
 
463 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679218  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6096  amino acid permease-associated region  82.07 
 
 
462 aa  751    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1550  amino acid permease-associated region  59.04 
 
 
462 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.29371  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3252  amino acid permease-associated region  48.6 
 
 
464 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719385  normal  0.223004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2573  amino acid permease-associated region  48.93 
 
 
457 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2586  amino acid ABC transporter permease  48.49 
 
 
470 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163018  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3130  amino acid permease-associated region  48.28 
 
 
460 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4749  amino acid permease-associated region  50.11 
 
 
457 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4368  amino acid permease-associated region  50.11 
 
 
457 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4455  amino acid permease-associated region  50.11 
 
 
457 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103538  normal  0.0381095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0357  amino acid permease-associated region  48.48 
 
 
449 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.510995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0415  putative transporter  49.54 
 
 
464 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.824759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04210  putative transporter  48.85 
 
 
464 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1229  amino acid ABC transporter permease  42.69 
 
 
450 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.674288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1258  amino acid permease-associated region  42.46 
 
 
450 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101609  normal  0.957729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1271  amino acid permease-associated region  40.6 
 
 
449 aa  332  9e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.633139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4189  amino acid permease-associated region  41.63 
 
 
450 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.121323  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3983  amino acid permease-associated region  41.67 
 
 
450 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2080  amino acid permease-associated region  41.72 
 
 
447 aa  328  9e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.88578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  41.78 
 
 
441 aa  326  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  41.93 
 
 
456 aa  326  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3246  putative amino acid permease  41.74 
 
 
456 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  41.15 
 
 
456 aa  322  9.000000000000001e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38130  putative amino acid permease  41.53 
 
 
456 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  39.82 
 
 
459 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1544  putative amino acid permease  43.15 
 
 
440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3215  amino acid permease-associated region  40.41 
 
 
455 aa  315  9e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52961  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  42.31 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2329  amino acid permease-associated region  40.88 
 
 
461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1826  amino acid permease  40.88 
 
 
461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1938  amino acid permease  40.65 
 
 
461 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.173953 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2029  amino acid permease family protein  40.74 
 
 
442 aa  312  9e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01273  putrescine importer  40.65 
 
 
461 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01284  hypothetical protein  40.65 
 
 
461 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1411  amino acid permease  40.65 
 
 
461 aa  312  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1505  amino acid permease  40.42 
 
 
461 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2350  amino acid permease-associated region  40.65 
 
 
461 aa  310  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17740  amino acid ABC transporter permease  42.3 
 
 
440 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2587  amino acid permease-associated region  42.69 
 
 
440 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.250393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3528  amino acid permease-associated region  41.27 
 
 
446 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4371  amino acid permease-associated region  41.27 
 
 
446 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3995  amino acid permease-associated region  41.27 
 
 
446 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140691  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1532  amino acid permease  40.65 
 
 
461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2517  amino acid permease-associated region  39.68 
 
 
463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0624875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2212  amino acid permease-associated region  39.87 
 
 
453 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2628  amino acid permease-associated region  40.37 
 
 
453 aa  303  6.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0615557  normal  0.778378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2421  amino acid permease family protein  39.45 
 
 
463 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3082  amino acid permease  39.45 
 
 
463 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  39.38 
 
 
443 aa  300  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1639  amino acid permease-associated region  40.32 
 
 
446 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00236467  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  39.38 
 
 
443 aa  299  7e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2314  amino acid permease-associated region  39.45 
 
 
453 aa  299  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3634  amino acid permease-associated region  39.14 
 
 
443 aa  299  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  39.14 
 
 
443 aa  299  9e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  40.88 
 
 
452 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  40.88 
 
 
452 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  40.88 
 
 
452 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  40.88 
 
 
452 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  40.88 
 
 
452 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  40.88 
 
 
452 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2152  amino acid permease  40.88 
 
 
452 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  40.88 
 
 
452 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2947  amino acid permease  40.88 
 
 
452 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.685998  hitchhiker  0.000000000177755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2405  amino acid permease  40.65 
 
 
452 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0506799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2246  amino acid permease  40.65 
 
 
452 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2295  amino acid permease  40.65 
 
 
452 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0751676 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2293  amino acid permease  40.65 
 
 
452 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.05629 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2192  amino acid permease  40.65 
 
 
452 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0587  amino acid permease-associated region  39.66 
 
 
443 aa  296  6e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  39.06 
 
 
443 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  39.29 
 
 
443 aa  296  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  39.06 
 
 
443 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7480  amino acid permease-associated region  43.58 
 
 
454 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0509  amino acid permease-associated region  39.06 
 
 
443 aa  292  8e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35860  amino acid permease  39.58 
 
 
434 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332281  decreased coverage  9.326859999999999e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2802  amino acid permease family protein  40 
 
 
443 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0413  amino acid permease-associated region  32.71 
 
 
454 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2164  amino acid permease-associated region  34.09 
 
 
455 aa  232  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  33.71 
 
 
449 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0116  amino acid transporter  32.27 
 
 
443 aa  219  7.999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  33.56 
 
 
449 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3016  amino acid transporter  30.68 
 
 
462 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  33.1 
 
 
449 aa  206  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23470  amino acid transporter  30.49 
 
 
465 aa  202  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00108461  hitchhiker  0.00000906997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2324  putative transporter  30.86 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0187  amino acid permease-associated region  29.64 
 
 
466 aa  199  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.20058  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1963  amino acid permease-associated region  32.53 
 
 
468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.281005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1529  amino acid permease-associated region  31.81 
 
 
473 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327796  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6300  amino acid permease-associated region  31.81 
 
 
473 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.819384 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6959  amino acid permease-associated region  30.87 
 
 
473 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.576881  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02208  amino acid transporter  33.55 
 
 
460 aa  182  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411846  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1513  amino acid transporter  31.71 
 
 
447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.490527  hitchhiker  0.0000000124915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1792  amino acid transporter  31.71 
 
 
447 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000593149  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1476  amino acid transporter  31.48 
 
 
447 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202307  normal  0.161402 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1492  amino acid transporter  32.26 
 
 
447 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.488484  hitchhiker  0.0000000000000168224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>