More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6006 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
386 aa  770    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  78.61 
 
 
393 aa  595  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  78.8 
 
 
390 aa  594  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  76.76 
 
 
390 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  59.03 
 
 
385 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  43.78 
 
 
376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  46.97 
 
 
388 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  44.39 
 
 
377 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  41.76 
 
 
374 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 
389 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  39.46 
 
 
384 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  37.63 
 
 
394 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 
378 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  36.63 
 
 
389 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  39.56 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  39.94 
 
 
383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  39.94 
 
 
383 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 
385 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  37.3 
 
 
391 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 
389 aa  205  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 
377 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  39.29 
 
 
375 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  34.48 
 
 
394 aa  200  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  37.33 
 
 
376 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  37.64 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  35.19 
 
 
394 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  39.18 
 
 
384 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  36.44 
 
 
389 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 
382 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
376 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  33.86 
 
 
378 aa  187  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  35.92 
 
 
380 aa  186  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 
382 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 
378 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
389 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  33.62 
 
 
394 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 
383 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 
382 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 
382 aa  142  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
984 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
983 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 
401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
444 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
444 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 
444 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
444 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  26.61 
 
 
460 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 
390 aa  124  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 
385 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 
396 aa  122  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
395 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
496 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  29.41 
 
 
500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
446 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 
960 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 
387 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 
500 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
442 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 
428 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 
381 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  28.13 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  28.61 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 
385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  28.13 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  28.13 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  28.13 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 
455 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  27.3 
 
 
378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 
374 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 
492 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
377 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 
382 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3289  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.25 
 
 
416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  25.39 
 
 
423 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
394 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
392 aa  110  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  28.41 
 
 
436 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  27.04 
 
 
446 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 
446 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  31.17 
 
 
378 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  36.94 
 
 
442 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
395 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
376 aa  106  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 
433 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2636  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.32 
 
 
416 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
415 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 
394 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 
819 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4046  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.8 
 
 
457 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 
398 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>