47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5821 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  410  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  64.41 
 
 
194 aa  208  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  32.96 
 
 
201 aa  64.3  1e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  28.12 
 
 
204 aa  59.3  4e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  28.35 
 
 
199 aa  56.2  4e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  26.52 
 
 
201 aa  55.1  7e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  30.94 
 
 
187 aa  54.3  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  30.94 
 
 
187 aa  54.3  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  30.94 
 
 
187 aa  54.3  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.48477e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  30.94 
 
 
187 aa  54.3  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  30.94 
 
 
187 aa  53.9  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  29.25 
 
 
197 aa  53.5  2e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.2506e-07 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2085  hypothetical protein  32.24 
 
 
184 aa  52.4  5e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.839519  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  26.52 
 
 
212 aa  51.2  1e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  25.25 
 
 
212 aa  50.1  2e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3046  hypothetical protein  27.32 
 
 
207 aa  49.7  3e-05  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.796041  normal  0.0181531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  32.04 
 
 
195 aa  49.3  4e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  34.93 
 
 
200 aa  48.9  5e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  34.15 
 
 
238 aa  48.9  5e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  34.15 
 
 
239 aa  48.5  8e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  34.15 
 
 
238 aa  48.5  8e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  34.15 
 
 
240 aa  48.1  8e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  32.79 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  29.45 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  29.45 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  28.08 
 
 
196 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  35.07 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  26.67 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  26.37 
 
 
188 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.57242e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  31.71 
 
 
240 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  28.08 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  26.58 
 
 
182 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  27.22 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  3.70009e-07 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  26.58 
 
 
182 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  26.88 
 
 
187 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.82452e-07  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  31.71 
 
 
242 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  28.17 
 
 
182 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.61465e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  26.88 
 
 
187 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.2581e-06  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  28.17 
 
 
182 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.76204e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  28.95 
 
 
187 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.40203e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  28.95 
 
 
187 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.85697e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  28.95 
 
 
187 aa  42.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.51515e-06  hitchhiker  2.97897e-06 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  28.95 
 
 
187 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.27636e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  26.88 
 
 
187 aa  42.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  37.25 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3180  lipoprotein, putative  27.33 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131862  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  29.35 
 
 
201 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>