More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5808 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5808  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
452 aa  912    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681195  decreased coverage  0.000412169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5284  AMP-binding domain protein  71.26 
 
 
656 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3530  AMP-binding domain protein  66.11 
 
 
662 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.771052  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5083  AMP-binding domain protein  64.61 
 
 
653 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5777  AMP-binding domain protein  64.61 
 
 
653 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.755359 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4401  AMP-binding domain protein  64.61 
 
 
653 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462133  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1999  AMP-binding domain protein  49.51 
 
 
658 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1134  AMP-binding domain protein  49.51 
 
 
658 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0925  AMP-binding domain protein  49.51 
 
 
658 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2138  AMP-binding domain protein  49.51 
 
 
658 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2376  AMP-binding domain protein  50.12 
 
 
786 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1980  AMP-binding domain protein  49.51 
 
 
658 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982582  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0234  AMP-binding domain protein  49.51 
 
 
658 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.346753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1574  AMP-binding domain protein  49.51 
 
 
658 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3562  AMP-binding domain protein  47.74 
 
 
633 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735849  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1245  AMP-binding domain protein  46.08 
 
 
632 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.988132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14060  AMP-binding domain protein  45.37 
 
 
632 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0382905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  40.05 
 
 
626 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1827  AMP-binding domain protein  37.25 
 
 
628 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.662967  normal  0.891796 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0853  AMP-binding domain protein  39.31 
 
 
632 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198925  normal  0.0889717 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0929  AMP-binding domain protein  37.59 
 
 
629 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.358411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7585  AMP-binding domain protein  35.53 
 
 
636 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2255  AMP-binding domain protein  37.47 
 
 
629 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2241  AMP-binding domain protein  37.01 
 
 
629 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.677791  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2913  AMP-binding domain protein  35.17 
 
 
629 aa  219  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.235786 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2005  AMP-binding domain protein  36.83 
 
 
629 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3885  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 
638 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.186226  normal  0.147677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2984  AMP-binding domain protein  37.68 
 
 
629 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0837  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
647 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00928833  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2637  AMP-binding domain protein  34.62 
 
 
638 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2607  AMP-binding domain protein  34.36 
 
 
638 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2651  AMP-binding domain protein  34.36 
 
 
638 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3543  AMP-binding domain protein  30.27 
 
 
660 aa  163  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1744  acyl-CoA synthetase  35.14 
 
 
617 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14345  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 
525 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.24 
 
 
520 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 
539 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 
577 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 
590 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 
561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.43 
 
 
594 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 
549 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.68 
 
 
561 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.45 
 
 
561 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 
565 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.61 
 
 
561 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 
554 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 
564 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 
532 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 
559 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.34 
 
 
582 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.34 
 
 
561 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.86 
 
 
563 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.07 
 
 
561 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.86 
 
 
563 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
578 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.86 
 
 
563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 
591 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  28.64 
 
 
585 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.86 
 
 
563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.86 
 
 
582 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 
584 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 
503 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 
551 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  30.52 
 
 
515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2096  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  30.37 
 
 
622 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 
569 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 
583 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  39.15 
 
 
491 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 
557 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0254  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 
567 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0249162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 
543 aa  114  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.7 
 
 
585 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 
485 aa  113  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 
518 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 
511 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 
564 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 
584 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  100 
 
 
1487 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  26.54 
 
 
586 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 
566 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 
573 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 
527 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 
549 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 
552 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  29.63 
 
 
507 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 
584 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 
584 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  26.13 
 
 
584 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.26 
 
 
514 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  25.89 
 
 
584 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 
584 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.86 
 
 
521 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 
577 aa  105  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 
508 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 
662 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3995  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 
537 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000737641  normal  0.189989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 
512 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  26.52 
 
 
583 aa  103  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  26.99 
 
 
575 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.444002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>