More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5434 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  76.95 
 
 
529 aa  784    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
539 aa  1081    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  74.91 
 
 
528 aa  783    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  77.55 
 
 
526 aa  807    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  75 
 
 
528 aa  786    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  77.55 
 
 
776 aa  803    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  61.76 
 
 
530 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.07 
 
 
530 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.57 
 
 
657 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.88 
 
 
657 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.5 
 
 
639 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.73 
 
 
845 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.62 
 
 
641 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
1084 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 
776 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 
938 aa  300  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 
776 aa  297  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5383  Signal transduction histidine kinase  37.52 
 
 
784 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.626951  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.71 
 
 
1361 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.39 
 
 
1371 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.85 
 
 
1261 aa  279  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 
1223 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2129  sensory box histidine kinase/response regulator  36.01 
 
 
746 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.706377  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  34.52 
 
 
1384 aa  276  6e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1939  PAS  35.65 
 
 
779 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627435  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.73 
 
 
1535 aa  273  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
866 aa  272  9e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
652 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  33.4 
 
 
1303 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
652 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 
1287 aa  260  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
1344 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.65 
 
 
869 aa  259  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  40.42 
 
 
547 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.39 
 
 
1408 aa  257  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 
664 aa  256  7e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 
1185 aa  256  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.12 
 
 
1698 aa  255  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.79 
 
 
1380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 
844 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
764 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
783 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  40.68 
 
 
518 aa  250  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
835 aa  249  7e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 
1406 aa  249  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05296  Two-component system protein A (EC 2.7.13.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P896]  31.83 
 
 
682 aa  249  9e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.47 
 
 
1088 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
660 aa  247  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
930 aa  246  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  37.78 
 
 
659 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
844 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.33 
 
 
1152 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 
761 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.27 
 
 
752 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
689 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
816 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
761 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  41.26 
 
 
755 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  42.48 
 
 
551 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.4 
 
 
1348 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2490  histidine kinase  41.03 
 
 
554 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
659 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
568 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.15 
 
 
1242 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.29 
 
 
738 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
906 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.37 
 
 
1759 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  36.08 
 
 
1015 aa  235  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  44.67 
 
 
741 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
1331 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
1222 aa  234  3e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2013  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
569 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00655857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
643 aa  230  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 
760 aa  229  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.27 
 
 
1233 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  40 
 
 
537 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
680 aa  228  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
1279 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
592 aa  227  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2075  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  39.79 
 
 
572 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.12 
 
 
1453 aa  227  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.71 
 
 
1218 aa  226  6e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
628 aa  226  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
934 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
650 aa  226  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  37.2 
 
 
2031 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 
955 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 
633 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
789 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
789 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
660 aa  223  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  38.5 
 
 
742 aa  223  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 
730 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 
1965 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  39.94 
 
 
714 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 
623 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 
720 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0535  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
383 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5775  histidine kinase  38.86 
 
 
554 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.941039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 
1391 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>