23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5390 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5390  hypothetical protein  100 
 
 
303 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00108195  hitchhiker  0.00662206 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5703  hypothetical protein  83.17 
 
 
303 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6457  hypothetical protein  83.28 
 
 
300 aa  524  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.275244 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6952  hypothetical protein  79.87 
 
 
303 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402722  normal  0.506284 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7056  hypothetical protein  81.37 
 
 
304 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1436  hypothetical protein  81.37 
 
 
304 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.428223  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6392  hypothetical protein  81.37 
 
 
304 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4449  signal peptide protein  65.33 
 
 
312 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3990  hypothetical protein  69.23 
 
 
299 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00349291  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5864  hypothetical protein  66.67 
 
 
299 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03196  signal peptide protein  64.85 
 
 
302 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4156  putative signal peptide protein  60.69 
 
 
309 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4268  signal peptide protein  60.69 
 
 
309 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4059  putative signal peptide protein  52.49 
 
 
306 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6267  putative signal peptide protein  55.12 
 
 
323 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5971  putative signal peptide protein  54.42 
 
 
292 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2457  putative signal peptide protein  53.16 
 
 
306 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1992  putative signal peptide protein  49.84 
 
 
311 aa  292  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.497766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2211  hypothetical protein  45.93 
 
 
309 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000554921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2016  hypothetical protein  41.72 
 
 
309 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000702566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2227  putative signal peptide protein  42.11 
 
 
331 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.094679  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1736  hypothetical protein  37.4 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.685716  normal  0.675321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2282  hypothetical protein  33.33 
 
 
333 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>