More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5305 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
240 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0723888  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3149  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.67 
 
 
240 aa  418  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85 
 
 
240 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85 
 
 
240 aa  410  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.819971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.75 
 
 
240 aa  405  1e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.17 
 
 
240 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76943  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10890  putative short-chain dehydrogenase  60.85 
 
 
241 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0306888  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0999  putative short-chain dehydrogenase  60.85 
 
 
241 aa  282  3e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5000  dehydrogenases with different specificities-like protein  90.24 
 
 
214 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.456323  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.21 
 
 
263 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117337  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2717  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.12 
 
 
241 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.46 
 
 
239 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.472803  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.64 
 
 
259 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.550074  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 
235 aa  197  1e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3054  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  47.28 
 
 
243 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.106955  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.7 
 
 
236 aa  195  5e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.96 
 
 
251 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.22 
 
 
251 aa  172  4e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326295 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
252 aa  172  4e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117337  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0481  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  43.22 
 
 
241 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2133  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  42.8 
 
 
241 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.617453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
231 aa  165  6e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3895  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.24 
 
 
248 aa  164  2e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.73 
 
 
234 aa  162  4e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.865732  hitchhiker  0.000720123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.17 
 
 
238 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.51 
 
 
246 aa  160  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
249 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3977  putative 2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  42.8 
 
 
255 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686311  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
252 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.09 
 
 
246 aa  158  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 
269 aa  158  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2406  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.95 
 
 
241 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
243 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.75 
 
 
255 aa  156  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
263 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0537  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40 
 
 
256 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
255 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
263 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
263 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
263 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
254 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0672528  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  36.44 
 
 
267 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000923  5-keto-D-gluconate 5-reductase  36.44 
 
 
253 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 
255 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.5 
 
 
260 aa  152  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.75 
 
 
246 aa  152  6e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
246 aa  151  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.3 
 
 
258 aa  151  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.66105e-05  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.15 
 
 
251 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.75 
 
 
246 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
274 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
254 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.799434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.48 
 
 
251 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
246 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0848  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.69 
 
 
253 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2989  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.69 
 
 
253 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0709919  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0873  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.69 
 
 
253 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3168  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.44 
 
 
253 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3233  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.44 
 
 
253 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  7.82926e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3248  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.44 
 
 
253 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0669  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.66 
 
 
259 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0399726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4111  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.29 
 
 
253 aa  148  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  decreased coverage  5.66262e-06 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3349  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.03 
 
 
253 aa  148  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.143786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2990  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.29 
 
 
253 aa  148  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.916776  normal  0.048185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3164  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.29 
 
 
253 aa  148  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.22 
 
 
248 aa  148  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1716  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.42 
 
 
253 aa  148  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3295  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.5 
 
 
253 aa  148  1e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1693  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.54 
 
 
253 aa  148  1e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.523034  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03889  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14350)  39.22 
 
 
394 aa  147  1e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.696227  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2643  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.54 
 
 
253 aa  148  1e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.802213  normal  0.105966 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1803  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.54 
 
 
253 aa  148  1e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0344  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.63 
 
 
258 aa  147  2e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.03 
 
 
248 aa  146  2e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.36759e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
251 aa  147  2e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.291293  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3185  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.03 
 
 
253 aa  147  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358502  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 
247 aa  146  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
251 aa  146  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0121204  normal  0.0331725 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
257 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 
516 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
255 aa  145  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  42.86 
 
 
261 aa  145  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
257 aa  145  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
254 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.82 
 
 
253 aa  145  7e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
250 aa  145  7e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
257 aa  145  8e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5273  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.66 
 
 
260 aa  144  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 
246 aa  144  9e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
246 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1719  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 
247 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2695  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  38.8 
 
 
277 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
264 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.21 
 
 
247 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.17117e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.96 
 
 
244 aa  143  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
254 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.21 
 
 
245 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.43 
 
 
254 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1360  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 
243 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  4.68393e-09  normal  0.0479743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>