More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5203 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5203  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
291 aa  584  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715781  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2821  LysR family transcriptional regulator  98.28 
 
 
291 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3317  LysR family transcriptional regulator  97.94 
 
 
291 aa  577  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.176434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4785  LysR family transcriptional regulator  97.94 
 
 
291 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3382  LysR family transcriptional regulator  97.94 
 
 
291 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4134  LysR family transcriptional regulator  97.94 
 
 
291 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5162  LysR family transcriptional regulator  97.59 
 
 
291 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0683  LysR family transcriptional regulator  75.27 
 
 
283 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4357  transcriptional regulator, LysR family  75.27 
 
 
283 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1608  LysR family transcriptional regulator  70.21 
 
 
287 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  71.38 
 
 
284 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1492  transcriptional regulator, LysR family  71.7 
 
 
271 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.403981  hitchhiker  0.0000917621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4219  LysR family transcriptional regulator  64.18 
 
 
283 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6632  LysR family transcriptional regulator  63.93 
 
 
282 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.994606 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5787  LysR family transcriptional regulator  63.21 
 
 
282 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6152  LysR family transcriptional regulator  63.21 
 
 
282 aa  364  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6037  LysR family transcriptional regulator  63.35 
 
 
283 aa  363  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5807  LysR family transcriptional regulator  63.35 
 
 
283 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7706  LysR family transcriptional regulator  63.44 
 
 
283 aa  359  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.364073  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  51.44 
 
 
296 aa  299  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  50.53 
 
 
293 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  51.61 
 
 
295 aa  299  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  44.49 
 
 
289 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
283 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
283 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
283 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5304  transcriptional regulator, LysR family  42.65 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3916  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0255667  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  42.35 
 
 
284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
284 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  37.85 
 
 
309 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
296 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
322 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  40.15 
 
 
299 aa  185  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  40.15 
 
 
313 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.85 
 
 
296 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  41.34 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1770  transcriptional regulator, LysR family  37.23 
 
 
284 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
294 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
299 aa  175  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4653  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.519057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  39.22 
 
 
293 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0525  LysR family transcriptional regulator  37.81 
 
 
316 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  33.69 
 
 
304 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.624518 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1278  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 
316 aa  165  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4935  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.929926  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 
289 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1467  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4417  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0255776 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2839  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
304 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2586  transcriptional regulator LysR family  36.69 
 
 
324 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.59 
 
 
291 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 
322 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2045  transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 
285 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000182672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 
322 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3081  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
323 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5283  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
285 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287276  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3396  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
290 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.356453  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0095  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
291 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0301  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
294 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3363  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
294 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443471  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 
285 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5004  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
294 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.492991  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0183  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0666  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
294 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.659834  normal  0.452137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2647  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
326 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 
279 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
294 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  37.81 
 
 
290 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3585  transcriptional regulator, LysR family  35.31 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0651173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
299 aa  152  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1911  LysR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
305 aa  152  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3040  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
282 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1578  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
367 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.170227  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  37.65 
 
 
332 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1448  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
321 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1478  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
286 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1252  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
286 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0535  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
286 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0618  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
286 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2806  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
286 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469753  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
289 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2713  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 
281 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0696841  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1238  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
282 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.804975  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  35.23 
 
 
291 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1266  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
328 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496224  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6530  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
292 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4490  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 
302 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2053  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5676  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>