More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5187 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
317 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  49.17 
 
 
311 aa  295  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  48.55 
 
 
314 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  46.25 
 
 
313 aa  288  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  47.56 
 
 
322 aa  288  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  48.08 
 
 
316 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  46.58 
 
 
311 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  49.19 
 
 
317 aa  285  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 
312 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  45.28 
 
 
314 aa  277  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  50.49 
 
 
318 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  48.72 
 
 
318 aa  276  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  46.91 
 
 
318 aa  275  8e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  44.95 
 
 
317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  46.91 
 
 
318 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  46.08 
 
 
342 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  45.6 
 
 
321 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.84 
 
 
318 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  46.45 
 
 
323 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  46.45 
 
 
313 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  49.36 
 
 
318 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  45.02 
 
 
316 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  46.01 
 
 
339 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  45.34 
 
 
325 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 
330 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  43.55 
 
 
319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 
326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  44.05 
 
 
320 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  46.75 
 
 
312 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
321 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  45.34 
 
 
312 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  46.33 
 
 
324 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  45.31 
 
 
322 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
316 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 
312 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 
312 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  42.72 
 
 
315 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
315 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  44.01 
 
 
315 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  44.01 
 
 
315 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 
315 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 
315 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 
315 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 
312 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  44.23 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  44.23 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  41.14 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  41.03 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.68 
 
 
338 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  40.45 
 
 
311 aa  208  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  40.45 
 
 
311 aa  208  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
322 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
322 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
338 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  40.81 
 
 
332 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  40.58 
 
 
310 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  40.82 
 
 
335 aa  203  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
322 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  40.28 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  40.33 
 
 
336 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  39.31 
 
 
327 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  40.69 
 
 
338 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  39.62 
 
 
338 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  39.17 
 
 
344 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  37.03 
 
 
349 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  37.03 
 
 
357 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  46.3 
 
 
387 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  39.12 
 
 
345 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.12 
 
 
344 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.12 
 
 
344 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 
344 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.63 
 
 
344 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.63 
 
 
344 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.63 
 
 
344 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  47.12 
 
 
343 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  39.44 
 
 
334 aa  182  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  47.12 
 
 
369 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.12 
 
 
369 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  47.12 
 
 
346 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4646  ThiJ/PfpI domain protein  37.46 
 
 
334 aa  182  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  47.12 
 
 
374 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 
354 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  47.12 
 
 
346 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  47.12 
 
 
346 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  40.07 
 
 
342 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  38.19 
 
 
362 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  35.87 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  38.02 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 
345 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  36.42 
 
 
328 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 
327 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  36.59 
 
 
321 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>