More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5114 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  90.95 
 
 
403 aa  651    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  100 
 
 
399 aa  748    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  91.9 
 
 
403 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  90.45 
 
 
403 aa  648    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  90.23 
 
 
400 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  91.21 
 
 
403 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  90.48 
 
 
400 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  91.64 
 
 
379 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  58.59 
 
 
395 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  59.09 
 
 
413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  61.13 
 
 
401 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  53.97 
 
 
408 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  55.06 
 
 
400 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  50.42 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  45.92 
 
 
451 aa  322  6e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  46.49 
 
 
396 aa  322  6e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  45.92 
 
 
451 aa  322  6e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  45.65 
 
 
412 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  45.65 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  45.65 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  45.65 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  46.74 
 
 
394 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  47.01 
 
 
402 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  48.06 
 
 
404 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  45.28 
 
 
402 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  48.46 
 
 
404 aa  299  5e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  48.4 
 
 
420 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 
403 aa  298  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  48.25 
 
 
403 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  48.25 
 
 
403 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 
407 aa  292  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 
408 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  44.22 
 
 
404 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  44.36 
 
 
397 aa  289  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  47.4 
 
 
408 aa  285  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  45.16 
 
 
411 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  42.93 
 
 
402 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  45.56 
 
 
376 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  42.78 
 
 
398 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 
396 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  44.16 
 
 
400 aa  275  8e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  44.21 
 
 
409 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  45.92 
 
 
402 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  41.62 
 
 
401 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 
410 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  42.55 
 
 
410 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
416 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  44.77 
 
 
402 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 
400 aa  259  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  43.94 
 
 
394 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  43.11 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  43.11 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 
397 aa  252  6e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 
433 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  43.29 
 
 
402 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 
412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 
384 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  42.62 
 
 
376 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  44.78 
 
 
395 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  38.07 
 
 
418 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 
415 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  38.11 
 
 
406 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  38.87 
 
 
415 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  37.63 
 
 
407 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  34.33 
 
 
408 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 
402 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  35.84 
 
 
408 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  35.84 
 
 
408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  38.73 
 
 
394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 
398 aa  196  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
402 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  35.32 
 
 
413 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  36.87 
 
 
410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 
422 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  31.89 
 
 
399 aa  182  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 
390 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 
735 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 
390 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  34.29 
 
 
392 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  33.43 
 
 
404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  35.2 
 
 
397 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  32.18 
 
 
399 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  31.36 
 
 
394 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 
387 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  32.71 
 
 
397 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  30.55 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  31.42 
 
 
451 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  32.49 
 
 
400 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  32.49 
 
 
400 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  29.92 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  33.42 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  29.69 
 
 
396 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  31.04 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  30 
 
 
410 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 
403 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  30.79 
 
 
404 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  31.67 
 
 
394 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  30.25 
 
 
396 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>