62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5095 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5095  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.296668  normal  0.288347 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3930  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  94.12 
 
 
341 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3590  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  93.28 
 
 
341 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102161  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2525  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  90.76 
 
 
338 aa  206  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74884  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5326  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  92.31 
 
 
338 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3496  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  91.53 
 
 
338 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0231638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6690  putative periplasmic substrate-binding subunit (ABC transporter)  48.31 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03032  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  43.22 
 
 
346 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.08661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  42.86 
 
 
338 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940543  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4122  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  41.53 
 
 
342 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4009  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  41.53 
 
 
342 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368962  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  39.5 
 
 
338 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1728  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  36.84 
 
 
333 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4505  NLPA lipoprotein  34.58 
 
 
342 aa  78.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.826664  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5990  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.93 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.626097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.19 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00383664  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.82 
 
 
350 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3889  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.73 
 
 
335 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  0.125658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0138  NLPA lipoprotein  33.94 
 
 
341 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4137  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  32.73 
 
 
341 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19179  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3152  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.82 
 
 
335 aa  70.9  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0512  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.75 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34770  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  32.11 
 
 
340 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.0167014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1606  NLPA lipoprotein  31.9 
 
 
346 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000297803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3603  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.09 
 
 
350 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3151  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.73 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3888  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.73 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2170  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  30 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541715  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0536  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  31.09 
 
 
342 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00532956  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0170  ABC transporter, periplasmic binding protein  33.03 
 
 
339 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0191  ABC transporter periplasmic-binding protein  33.03 
 
 
339 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30920  ABC transporter, periplasmic binding protein  28.83 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2677  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.09 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0189  ABC transporter, periplasmic binding protein  33.03 
 
 
339 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.366153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5057  ABC transporter, periplasmic binding protein  32.11 
 
 
339 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.64 
 
 
334 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5060  ABC transporter substrate-binding protein  32.38 
 
 
327 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3450  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30 
 
 
343 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302208  hitchhiker  0.000774086 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6535  ABC transporter substrate binding protein  32.73 
 
 
351 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1388  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.14 
 
 
317 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6250  ABC transporter substrate binding protein  32.73 
 
 
351 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126747  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1120  ABC transporter, periplasmic binding protein  32.35 
 
 
334 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1399  ABC transporter periplasmic binding protein  30.17 
 
 
341 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1797  ABC transporter periplasmic binding protein  29.31 
 
 
340 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6192  ABC transporter substrate binding protein  31.82 
 
 
343 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0340  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.82 
 
 
339 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1244  ABC transporter substrate binding protein  31.82 
 
 
343 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6588  ABC transporter substrate binding protein  31.82 
 
 
343 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5195  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30 
 
 
339 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2032  ABC transporter substrate binding protein  26.36 
 
 
348 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1687  ABC transporter substrate binding protein  26.36 
 
 
348 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0343  ABC transporter substrate-binding protein  26.36 
 
 
348 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1866  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.36 
 
 
348 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.346438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1878  ABC transporter substrate binding protein  26.36 
 
 
348 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0818  ABC transporter substrate binding protein  26.36 
 
 
348 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6244  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  33.33 
 
 
334 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2205  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.91 
 
 
337 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3259  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  28.45 
 
 
336 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3455  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  26.61 
 
 
347 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6049  ABC transporter substrate binding protein  30.91 
 
 
351 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4888  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  25.86 
 
 
332 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.962716  normal  0.144986 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1299  ABC transporter periplasmic binding protein  30.17 
 
 
362 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>