More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4906 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
256 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  88.67 
 
 
255 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  88.67 
 
 
255 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  87.6 
 
 
257 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  87.6 
 
 
257 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  87.6 
 
 
257 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  82.95 
 
 
257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  72.2 
 
 
255 aa  362  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  72.09 
 
 
255 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  72.09 
 
 
255 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  71.71 
 
 
255 aa  358  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  69.69 
 
 
257 aa  348  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  70.43 
 
 
259 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  69.65 
 
 
259 aa  335  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  48.45 
 
 
255 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
263 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  29.22 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 
254 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  33.06 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  34.12 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  33.33 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  35.74 
 
 
240 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  31.85 
 
 
250 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.96 
 
 
287 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  34.54 
 
 
240 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
248 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 
255 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 
254 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  27.54 
 
 
259 aa  96.3  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  27.67 
 
 
270 aa  95.1  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  26.88 
 
 
270 aa  92.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  31.91 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  29.48 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  26.12 
 
 
275 aa  86.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  29.96 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  43.14 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  43.3 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  41.49 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  38.38 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  38.38 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  38.38 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  38.38 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 
326 aa  72  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  38.38 
 
 
113 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  37.76 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  40.22 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  32.74 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  38.54 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  37.42 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 
319 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  41.57 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  37.37 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  37.37 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  28.81 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.64 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
291 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3696  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  37.61 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  40.22 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
113 aa  67  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  34.86 
 
 
325 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  39.51 
 
 
315 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0278  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  36.36 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
316 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 
296 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 
345 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>