More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4579 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  78.56 
 
 
482 aa  760    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  100 
 
 
487 aa  967    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  94.25 
 
 
507 aa  904    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  78.72 
 
 
484 aa  761    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  73.19 
 
 
471 aa  708    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  50.22 
 
 
478 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  28.81 
 
 
454 aa  211  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  33.26 
 
 
489 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  33.06 
 
 
489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  33.06 
 
 
489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  32.85 
 
 
489 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  31.05 
 
 
496 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  29.54 
 
 
478 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  31.09 
 
 
514 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  30.56 
 
 
475 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  30.34 
 
 
475 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  30.34 
 
 
475 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  30.87 
 
 
475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  29.61 
 
 
493 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  31.52 
 
 
477 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  31.52 
 
 
477 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  29.77 
 
 
499 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  28.16 
 
 
480 aa  117  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  27.35 
 
 
464 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  24.5 
 
 
476 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  27.18 
 
 
445 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  28.54 
 
 
438 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  28.24 
 
 
446 aa  103  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  26.15 
 
 
442 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  26.94 
 
 
468 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  26.94 
 
 
468 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  26.75 
 
 
468 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  26.75 
 
 
468 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  26.75 
 
 
468 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  27.05 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
458 aa  99.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  27.4 
 
 
443 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
443 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  27.4 
 
 
443 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  27.4 
 
 
443 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  27.4 
 
 
443 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  27.4 
 
 
443 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  27.07 
 
 
470 aa  97.1  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  27.4 
 
 
443 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  26.68 
 
 
452 aa  97.1  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  27.75 
 
 
442 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  27.4 
 
 
443 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  23.84 
 
 
427 aa  86.7  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  25.68 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  27.61 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  25 
 
 
458 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 
448 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  25.58 
 
 
471 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  24.29 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  23.82 
 
 
482 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  25 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  24.68 
 
 
469 aa  78.2  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
508 aa  78.6  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 
460 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00600  trehalose transport-related protein, putative  26.57 
 
 
563 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.633366  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  25.91 
 
 
482 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  26.03 
 
 
490 aa  73.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  27.43 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  24.06 
 
 
499 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  24.18 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  23.5 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  21.33 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  25.81 
 
 
480 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  24.07 
 
 
464 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 
483 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  24.88 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  25.84 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  25.91 
 
 
438 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02892  MFS sugar permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12040)  27.09 
 
 
525 aa  71.6  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  24.72 
 
 
463 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  25.41 
 
 
452 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1813  major facilitator transporter  23.62 
 
 
480 aa  71.2  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47769  predicted protein  30.2 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
460 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3410  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 
484 aa  71.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  25.41 
 
 
452 aa  70.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  25.41 
 
 
452 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  28.11 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  27.79 
 
 
437 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  28.11 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  25.91 
 
 
438 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  27.37 
 
 
526 aa  69.7  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  24.63 
 
 
443 aa  69.7  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  23.45 
 
 
480 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  23.59 
 
 
477 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  27.56 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  26.93 
 
 
439 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00460  alpha-glucoside transport-related protein, putative  25.09 
 
 
563 aa  68.6  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0199479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  22.25 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>