186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4389 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
260 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  86.15 
 
 
260 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  85.77 
 
 
260 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  86.54 
 
 
260 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  86.54 
 
 
260 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  86.54 
 
 
260 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  86.54 
 
 
260 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  69.75 
 
 
269 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  69.75 
 
 
269 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  69.75 
 
 
269 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  69.75 
 
 
269 aa  328  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  69.75 
 
 
269 aa  328  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  69.75 
 
 
312 aa  327  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  69.33 
 
 
269 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  69.07 
 
 
344 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
240 aa  260  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  53.85 
 
 
242 aa  255  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.75 
 
 
267 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
267 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.14 
 
 
244 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.43 
 
 
244 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.43 
 
 
244 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 
238 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.57 
 
 
238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.56 
 
 
239 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.56 
 
 
239 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.66 
 
 
239 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.7 
 
 
243 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.23 
 
 
239 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.7 
 
 
243 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.23 
 
 
239 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.7 
 
 
243 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
239 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.12 
 
 
239 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.53 
 
 
232 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.58 
 
 
254 aa  223  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.67 
 
 
239 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.66 
 
 
246 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.09 
 
 
232 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.64 
 
 
232 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  49.1 
 
 
245 aa  221  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  47.35 
 
 
239 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.81 
 
 
240 aa  219  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.67 
 
 
239 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.96 
 
 
239 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.32 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  51.42 
 
 
239 aa  215  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  45.02 
 
 
255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  46.43 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.73 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.75 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.09 
 
 
239 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.93 
 
 
244 aa  210  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.98 
 
 
243 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.59 
 
 
263 aa  205  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
268 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  43.39 
 
 
439 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.68 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  40.68 
 
 
246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
340 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
242 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  44.92 
 
 
274 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.85 
 
 
340 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  41.74 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.36 
 
 
255 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  43.53 
 
 
242 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.07 
 
 
255 aa  186  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.86 
 
 
245 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  41.33 
 
 
234 aa  175  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
248 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  38.7 
 
 
252 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.33 
 
 
260 aa  168  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  39.33 
 
 
260 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  39.33 
 
 
260 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  39.33 
 
 
260 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  37.89 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.08 
 
 
262 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  39.91 
 
 
259 aa  159  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
231 aa  159  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.36 
 
 
279 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4112  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
260 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21872  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3638  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
260 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810251  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
236 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  36.36 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.21 
 
 
251 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.36 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.71 
 
 
247 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  36.36 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  36.36 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  36.36 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  36.36 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  36.36 
 
 
264 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.61 
 
 
338 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1943  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
258 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.706004  decreased coverage  0.00341057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
232 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2074  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.36 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.83722  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2421  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269594  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  35.24 
 
 
230 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>