More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4283 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4039  porin  85.79 
 
 
379 aa  657  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  100 
 
 
380 aa  764  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  86.32 
 
 
380 aa  662  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  85.53 
 
 
380 aa  675  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  86.32 
 
 
380 aa  661  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  90 
 
 
380 aa  701  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  86.05 
 
 
380 aa  664  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  75.79 
 
 
411 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  67.79 
 
 
384 aa  515  1e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  67.79 
 
 
384 aa  515  1e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  67.01 
 
 
384 aa  511  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  67.53 
 
 
384 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  67.53 
 
 
384 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  67.53 
 
 
384 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  67.01 
 
 
384 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  60.51 
 
 
390 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  63.74 
 
 
383 aa  458  1e-128  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  61.3 
 
 
383 aa  452  1e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  59.33 
 
 
383 aa  452  1e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  62.33 
 
 
409 aa  447  1e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  62.37 
 
 
391 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  53.3 
 
 
383 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  53.55 
 
 
383 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  52.28 
 
 
379 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  52.03 
 
 
379 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  4.14234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  52.03 
 
 
379 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  3.37977e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  52.28 
 
 
379 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  52.28 
 
 
379 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  51.52 
 
 
379 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  52.67 
 
 
379 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  52.03 
 
 
381 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.10275e-08  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  53.12 
 
 
374 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  52.67 
 
 
380 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  9.49722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  52.67 
 
 
380 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  49.75 
 
 
381 aa  355  8e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  52.23 
 
 
379 aa  348  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  48.87 
 
 
384 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  50.62 
 
 
381 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  48.86 
 
 
383 aa  342  8e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  50.5 
 
 
381 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  48.22 
 
 
383 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  50 
 
 
375 aa  332  7e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  49.12 
 
 
383 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  50.26 
 
 
375 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  48.5 
 
 
384 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  48.5 
 
 
384 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  48.5 
 
 
384 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  48.5 
 
 
384 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  48.5 
 
 
384 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  48.5 
 
 
384 aa  330  4e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  48.5 
 
 
384 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  48 
 
 
414 aa  326  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  50.63 
 
 
384 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  48.97 
 
 
375 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  48.97 
 
 
375 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  49.12 
 
 
392 aa  314  2e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  49.05 
 
 
375 aa  312  6e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  47.48 
 
 
385 aa  308  8e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  45.45 
 
 
381 aa  305  1e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  44.84 
 
 
383 aa  304  2e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  47.76 
 
 
384 aa  302  7e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  49.74 
 
 
363 aa  301  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  46.62 
 
 
391 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  46.97 
 
 
384 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  46.97 
 
 
384 aa  298  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  46.15 
 
 
396 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  46.97 
 
 
384 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  46.97 
 
 
384 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  46.97 
 
 
384 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  45.77 
 
 
387 aa  295  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  46.12 
 
 
409 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  46.12 
 
 
409 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  47.29 
 
 
377 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  45.64 
 
 
394 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  45.38 
 
 
385 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  48.97 
 
 
362 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  48.97 
 
 
362 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  48.97 
 
 
362 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  46.77 
 
 
377 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  46.6 
 
 
385 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  44.05 
 
 
394 aa  289  5e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  46.6 
 
 
385 aa  289  5e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  44.68 
 
 
386 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  45.91 
 
 
384 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  42.16 
 
 
376 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  48.85 
 
 
361 aa  285  6e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  48.6 
 
 
372 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  48.6 
 
 
372 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  45.48 
 
 
389 aa  285  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  46.68 
 
 
383 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  47.06 
 
 
374 aa  284  1e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  45.2 
 
 
383 aa  285  1e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  46.17 
 
 
383 aa  284  2e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  47.06 
 
 
374 aa  284  2e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  46.8 
 
 
374 aa  283  4e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  44.7 
 
 
382 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.92 
 
 
383 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  46.68 
 
 
376 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  46.68 
 
 
376 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  46.68 
 
 
376 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>