More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4204 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4307  porin  81.34 
 
 
418 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  82.76 
 
 
403 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  81.34 
 
 
418 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  82.76 
 
 
403 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  87.18 
 
 
403 aa  700    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  100 
 
 
471 aa  952    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  84.62 
 
 
398 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  79.49 
 
 
419 aa  632  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1125  outer membrane porin OpcP, putative  81.07 
 
 
407 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61922  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0932  putative outer membrane porin  81.07 
 
 
407 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0227  putative outer membrane porin  81.07 
 
 
407 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1567  putative outer membrane porin  81.07 
 
 
407 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0706686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2009  outer membrane porin  81.07 
 
 
407 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2144  outer membrane protein  80.8 
 
 
419 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  80.8 
 
 
407 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  48.59 
 
 
391 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  48.07 
 
 
409 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  48.07 
 
 
409 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  46.91 
 
 
383 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  46.39 
 
 
383 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  47.04 
 
 
384 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  47.79 
 
 
386 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  47.49 
 
 
386 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  47.53 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  47.34 
 
 
381 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  46.58 
 
 
381 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  46.33 
 
 
381 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  44.39 
 
 
384 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  46.39 
 
 
375 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  44.84 
 
 
383 aa  299  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  44.58 
 
 
383 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  44.5 
 
 
379 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  45.5 
 
 
374 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  44.39 
 
 
379 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  44.39 
 
 
379 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  44.39 
 
 
379 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  44.13 
 
 
379 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  44.13 
 
 
379 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  45.91 
 
 
379 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  43.58 
 
 
381 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  44.07 
 
 
375 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  43.7 
 
 
392 aa  286  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.62 
 
 
379 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  43.56 
 
 
375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  43.56 
 
 
375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  44.89 
 
 
384 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  44.89 
 
 
384 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  44.89 
 
 
384 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  46.35 
 
 
383 aa  280  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  44.89 
 
 
384 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  44.64 
 
 
384 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  44.64 
 
 
384 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  44.83 
 
 
380 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  45.41 
 
 
383 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  45.07 
 
 
375 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  44.67 
 
 
383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  44.3 
 
 
380 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  43.37 
 
 
376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  43.89 
 
 
384 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  42.4 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  42.4 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  42.4 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  42.4 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  42.4 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  42.4 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  42.4 
 
 
384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  44.5 
 
 
391 aa  269  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  42.13 
 
 
414 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  44.17 
 
 
380 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  42.78 
 
 
390 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  42.59 
 
 
384 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  42.86 
 
 
384 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  42.59 
 
 
384 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  42.59 
 
 
384 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  42.72 
 
 
381 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  40.91 
 
 
384 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  42.25 
 
 
384 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  41.69 
 
 
383 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  40.64 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  44.36 
 
 
409 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  41.48 
 
 
385 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  42.75 
 
 
380 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  41.23 
 
 
385 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  41 
 
 
383 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  42 
 
 
380 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  42.56 
 
 
380 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  43.12 
 
 
382 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  40.25 
 
 
389 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  42.56 
 
 
380 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  41.5 
 
 
391 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  42.35 
 
 
391 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  43.01 
 
 
379 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  43.08 
 
 
380 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  41.59 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  42.97 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  42.97 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  42.97 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  41.21 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  41.3 
 
 
386 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  40.94 
 
 
389 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>