More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4095 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  76.44 
 
 
452 aa  703    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  90.82 
 
 
425 aa  810    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  76.44 
 
 
497 aa  708    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  76.89 
 
 
452 aa  710    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  91.53 
 
 
425 aa  822    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  91.29 
 
 
425 aa  818    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  77.75 
 
 
492 aa  709    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  92.71 
 
 
425 aa  828    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  76.44 
 
 
452 aa  703    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  76.44 
 
 
452 aa  703    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  91.29 
 
 
425 aa  813    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  76.67 
 
 
452 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  92.71 
 
 
425 aa  828    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  76.44 
 
 
452 aa  703    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 
425 aa  880    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  92.71 
 
 
425 aa  828    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.33 
 
 
427 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  65 
 
 
427 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  65.4 
 
 
429 aa  541  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5692  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  56.62 
 
 
428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0139384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4612  cytochrome c, class I  56.36 
 
 
428 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3756  cytochrome c, class I  56.36 
 
 
428 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.7 
 
 
426 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.79 
 
 
474 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.09 
 
 
469 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.38 
 
 
466 aa  389  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.5 
 
 
426 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  47.7 
 
 
501 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.37 
 
 
432 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.16 
 
 
434 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  47.02 
 
 
432 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  46.82 
 
 
432 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.82 
 
 
432 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  46.82 
 
 
432 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  48.16 
 
 
434 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  48.16 
 
 
434 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  47.7 
 
 
439 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  45.72 
 
 
430 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.91 
 
 
441 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  45.93 
 
 
450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48 
 
 
434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.68 
 
 
448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  44.73 
 
 
439 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.76 
 
 
422 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.99 
 
 
447 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3802  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.91 
 
 
455 aa  352  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.503165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.74 
 
 
447 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  45.41 
 
 
439 aa  349  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  45.2 
 
 
433 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.09 
 
 
453 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  45.96 
 
 
434 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  44.61 
 
 
477 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.58 
 
 
415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  45.54 
 
 
439 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.72 
 
 
475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  43.42 
 
 
450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  44.72 
 
 
475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  44.72 
 
 
475 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.8 
 
 
477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4265  cytochrome c, class I  46.12 
 
 
466 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105526  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.78 
 
 
417 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.86 
 
 
415 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.55 
 
 
417 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.96 
 
 
426 aa  332  6e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  44.47 
 
 
470 aa  332  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.1 
 
 
448 aa  331  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  43.86 
 
 
437 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.91 
 
 
454 aa  326  5e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.92 
 
 
469 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.7 
 
 
451 aa  325  9e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.08 
 
 
395 aa  322  8e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.98 
 
 
440 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  39.9 
 
 
463 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0689  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.16 
 
 
447 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  41.79 
 
 
473 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.58 
 
 
448 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  41.31 
 
 
675 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  40.96 
 
 
476 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.81 
 
 
467 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.08 
 
 
439 aa  312  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  41.08 
 
 
675 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.36 
 
 
434 aa  309  5.9999999999999995e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0943  cytochrome c family protein  41.56 
 
 
650 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.57 
 
 
537 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0780  cytochrome c family protein  41.56 
 
 
476 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00190536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0768  cytochrome c family protein  41.56 
 
 
482 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00254  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.8 
 
 
531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  41.33 
 
 
728 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.71 
 
 
432 aa  302  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  42.5 
 
 
527 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  42.5 
 
 
527 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  41.5 
 
 
436 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  41.5 
 
 
436 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.5 
 
 
436 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.87 
 
 
689 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.57 
 
 
531 aa  300  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3842  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.19 
 
 
436 aa  299  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.44 
 
 
470 aa  298  9e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.05 
 
 
726 aa  298  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  41.28 
 
 
407 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>