More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4039 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  84.64 
 
 
384 aa  656    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  84.64 
 
 
384 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  84.64 
 
 
384 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  84.64 
 
 
384 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  89.32 
 
 
384 aa  666    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  100 
 
 
384 aa  768    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  89.32 
 
 
384 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  90.89 
 
 
384 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  84.64 
 
 
384 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  83.59 
 
 
414 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  91.93 
 
 
384 aa  686    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  91.93 
 
 
384 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  84.64 
 
 
384 aa  656    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  84.64 
 
 
384 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  89.32 
 
 
384 aa  666    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  67.96 
 
 
383 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  65.85 
 
 
386 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  63.9 
 
 
381 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  62.24 
 
 
383 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  64.03 
 
 
385 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  61.81 
 
 
394 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  61.5 
 
 
396 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  64.64 
 
 
386 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  62.31 
 
 
394 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  59.43 
 
 
383 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  57.77 
 
 
382 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  52.33 
 
 
381 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  50.65 
 
 
383 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  51.04 
 
 
377 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  51.39 
 
 
383 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  51.14 
 
 
383 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  53.83 
 
 
380 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  51.28 
 
 
379 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  51.03 
 
 
379 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  52.81 
 
 
380 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  51.03 
 
 
379 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  51.03 
 
 
379 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  51.28 
 
 
379 aa  358  6e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  50.77 
 
 
379 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  53.06 
 
 
379 aa  358  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  52.09 
 
 
374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  51.67 
 
 
383 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  50.55 
 
 
382 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  51.4 
 
 
381 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  48.72 
 
 
386 aa  349  4e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  50 
 
 
379 aa  345  8e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  49.61 
 
 
383 aa  342  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  49.24 
 
 
381 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  49.49 
 
 
384 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  49.13 
 
 
384 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  49.11 
 
 
381 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  48.88 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  48.88 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  48.88 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  48.88 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  48.88 
 
 
384 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  48.18 
 
 
389 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  48.18 
 
 
389 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  48.63 
 
 
384 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  50.26 
 
 
384 aa  329  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  47.92 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  47.07 
 
 
391 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  48.15 
 
 
381 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  49.5 
 
 
377 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  47.64 
 
 
384 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  46.61 
 
 
380 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  49.11 
 
 
377 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  47.45 
 
 
382 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  47.45 
 
 
382 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  48.96 
 
 
376 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  47 
 
 
391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  46.75 
 
 
409 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  46.75 
 
 
409 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  47.25 
 
 
390 aa  311  9e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  47.86 
 
 
383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  47.55 
 
 
375 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  48.51 
 
 
385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  48.26 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  46.5 
 
 
380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  47.29 
 
 
375 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  47.28 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  47.28 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  47.28 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  46 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  47.28 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  47.28 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  47.03 
 
 
375 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  47.03 
 
 
375 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  47.28 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  47.41 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  47.41 
 
 
383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  46.78 
 
 
436 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  47.03 
 
 
386 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  45.96 
 
 
391 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  46.5 
 
 
383 aa  301  9e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  48.59 
 
 
363 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  49.75 
 
 
389 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  45.93 
 
 
389 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.5 
 
 
383 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  49.88 
 
 
389 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>