More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3980 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
310 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  89.17 
 
 
314 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  89.17 
 
 
314 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  93.81 
 
 
298 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  93.81 
 
 
298 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  93.81 
 
 
298 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  93.75 
 
 
297 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  91.58 
 
 
316 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  90.48 
 
 
316 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  90.48 
 
 
316 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  90.84 
 
 
316 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  90.48 
 
 
316 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  90.48 
 
 
316 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  90.48 
 
 
316 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  90.48 
 
 
316 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  76.9 
 
 
324 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  78.26 
 
 
324 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  72.52 
 
 
318 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  65.7 
 
 
294 aa  355  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  65.81 
 
 
284 aa  349  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  66.54 
 
 
286 aa  348  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  64.75 
 
 
284 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  64.77 
 
 
294 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  64.75 
 
 
284 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  64.75 
 
 
284 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  64.75 
 
 
284 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  64.75 
 
 
284 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  64.75 
 
 
284 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  64.75 
 
 
284 aa  346  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  64.6 
 
 
285 aa  346  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  63.08 
 
 
285 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  63.08 
 
 
285 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  63.08 
 
 
285 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  63.67 
 
 
284 aa  341  9e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  65.04 
 
 
285 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  62.37 
 
 
285 aa  338  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  56.42 
 
 
279 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  51.88 
 
 
275 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  51.88 
 
 
275 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  54.41 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  54.48 
 
 
285 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  49.61 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  52.71 
 
 
278 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  50 
 
 
278 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 
264 aa  185  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  43.2 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
268 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
261 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  37.61 
 
 
264 aa  136  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 
260 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
267 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  29.13 
 
 
260 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.5 
 
 
278 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
260 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 
267 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
271 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.35 
 
 
260 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  28.35 
 
 
260 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
261 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
260 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
267 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 
267 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  34.78 
 
 
278 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.77 
 
 
265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 
253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  28.21 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
262 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  32.74 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.17 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
277 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
269 aa  113  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
274 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
275 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  35.34 
 
 
274 aa  112  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.72 
 
 
254 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
275 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
319 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.19 
 
 
272 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4406  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.98 
 
 
257 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 
259 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 
277 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  31.88 
 
 
308 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>