More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3781 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
312 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  91.99 
 
 
315 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  87.94 
 
 
315 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  87.62 
 
 
315 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  91.67 
 
 
315 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  87.62 
 
 
315 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  85.71 
 
 
315 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  70.23 
 
 
311 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  70.23 
 
 
311 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  64.74 
 
 
312 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  57.37 
 
 
311 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  56.44 
 
 
307 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  58.55 
 
 
306 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  57.1 
 
 
306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  56.72 
 
 
306 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  54.43 
 
 
306 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  58.22 
 
 
307 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  52.27 
 
 
307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  55.66 
 
 
311 aa  305  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  53.99 
 
 
310 aa  298  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  52.87 
 
 
312 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  52.79 
 
 
306 aa  293  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  53.04 
 
 
312 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  54.84 
 
 
312 aa  289  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  55.45 
 
 
314 aa  287  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  53.42 
 
 
305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  52.72 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  54.75 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  52.22 
 
 
305 aa  258  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  50.47 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  51.13 
 
 
313 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  45.34 
 
 
323 aa  246  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  49.84 
 
 
321 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  43.93 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  49.19 
 
 
312 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  43.42 
 
 
307 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  41.25 
 
 
314 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  47.59 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  45.66 
 
 
310 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  42.43 
 
 
306 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  43.69 
 
 
307 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  41.38 
 
 
304 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  41.04 
 
 
308 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  35.05 
 
 
314 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  43.27 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  34.92 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  35.4 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  33.56 
 
 
314 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  35.05 
 
 
314 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  34.71 
 
 
314 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  34.71 
 
 
314 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  35.05 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  35.05 
 
 
314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  41.97 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  40.4 
 
 
307 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  35.71 
 
 
307 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  35.36 
 
 
307 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  36.12 
 
 
318 aa  122  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  27.87 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  35.1 
 
 
315 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  34.29 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 
336 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.47 
 
 
315 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  31.12 
 
 
315 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0050  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 
335 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  32.76 
 
 
302 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  29.73 
 
 
337 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  30.48 
 
 
312 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.23 
 
 
316 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 
335 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.23 
 
 
316 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2416  2-dehydropantoate 2-reductase  26.98 
 
 
335 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.483923  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2139  2-dehydropantoate 2-reductase  26.98 
 
 
335 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.147044  normal  0.399133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2099  2-dehydropantoate 2-reductase  26.98 
 
 
335 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  31.17 
 
 
310 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 
316 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 
341 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  30.28 
 
 
316 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  29.28 
 
 
326 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  31.82 
 
 
302 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  34.76 
 
 
323 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  30.64 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  31.02 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2981  2-dehydropantoate 2-reductase  25.82 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3758  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  32.56 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 
312 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  29.9 
 
 
314 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  26.63 
 
 
342 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1293  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 
312 aa  92.8  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  30.6 
 
 
299 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  25.9 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  24.56 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3361  2-dehydropantoate 2-reductase  30.33 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.97 
 
 
317 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 
325 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  27.56 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  26.33 
 
 
333 aa  89.7  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  30 
 
 
310 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
316 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>