More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3528 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3528  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
353 aa  707    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0543  LysR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
309 aa  290  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791494  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2085  LysR family transcriptional regulator  49.84 
 
 
325 aa  281  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0073681  normal  0.210389 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3916  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 
323 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.61928 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4003  LysR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
339 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4363  LysR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
339 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3409  LysR family transcriptional regulator  49.34 
 
 
325 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155989  normal  0.11434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3520  LysR family transcriptional regulator  48.87 
 
 
319 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.677616 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  50.49 
 
 
298 aa  265  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2417  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 
306 aa  262  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000194873  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6199  transcriptional regulator, LysR family  46.5 
 
 
308 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2151  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  48.2 
 
 
297 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  47.04 
 
 
295 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  47.39 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1659  LysR family transcriptional regulator  48.09 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.337839  normal  0.66809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0399  LysR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1317  transcriptional regulator, LysR family  46.86 
 
 
304 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0017  LysR family transcriptional regulator  45.67 
 
 
301 aa  236  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1887  transcriptional regulator, LysR family  43.97 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.337699  normal  0.210949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0978  LysR family transcriptional regulator  47.7 
 
 
298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3422  LysR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4829  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
301 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.732539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5422  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
295 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906945  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5440  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0141  LysR family transcriptional regulator  41.48 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3501  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 
301 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.356591  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2247  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 
307 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4870  LysR family transcriptional regulator  43.22 
 
 
313 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6632  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946509  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2321  putative transcriptional regulator  37.66 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46370  Transcriptional regulator, LysR-family  41.5 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992428  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6857  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 
307 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561705  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1717  transcriptional regulator, LysR family  40.42 
 
 
323 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3381  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.750017  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2839  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 
300 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4578  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
301 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166046  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4455  LysR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1270  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27440  putative transcriptional regulator  37.66 
 
 
321 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016223  normal  0.601013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0871  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 
302 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3329  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2499  LysR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
278 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.178908  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1706  transcriptional regulator, LysR family  37.22 
 
 
317 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0459  transcriptional regulator, LysR family  35.47 
 
 
308 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00764777  normal  0.120091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  36.6 
 
 
307 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5091  transcriptional regulator, LysR family  38.77 
 
 
328 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.269776 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2136  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 
303 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2834  hypothetical protein  35.43 
 
 
309 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4909  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622222  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4218  transcriptional regulator, LysR family  37.18 
 
 
300 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.66 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 
306 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  34.21 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.56 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0997  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940452  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
332 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2067  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 
307 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
301 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  33.64 
 
 
314 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2167  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1894  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0253  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.88055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1710  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3589  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5101  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.428224  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0352  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  28.84 
 
 
318 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0296  transcriptional regulator, LysR family protein  28.48 
 
 
327 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35272  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0912  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
311 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00635337  normal  0.114981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 
297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
298 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0260  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 
297 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.184545  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2018  transcription regulator protein  33.44 
 
 
321 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.416664  normal  0.213867 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2402  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
306 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.298095  unclonable  0.0000087148 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2060  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 
306 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.670506  unclonable  0.00000000000294805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
315 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  27.18 
 
 
309 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2285  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
306 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000341943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
432 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2248  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 
316 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0456314  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
302 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.11 
 
 
299 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 
304 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2064  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
306 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
323 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3446  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
312 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000932924  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2409  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
306 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  33.23 
 
 
312 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
308 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2222  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
314 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.176511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>