More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3342 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3342  porin  100 
 
 
386 aa  762    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  91.45 
 
 
384 aa  701    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  89.64 
 
 
383 aa  689    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  93.52 
 
 
386 aa  690    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  87.56 
 
 
385 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  87.56 
 
 
385 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  87.31 
 
 
385 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  81.35 
 
 
422 aa  557  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  81.35 
 
 
382 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  81.09 
 
 
424 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  81.35 
 
 
382 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  73.21 
 
 
384 aa  542  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  69.9 
 
 
388 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  71.87 
 
 
387 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  67.55 
 
 
388 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  61.68 
 
 
387 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  54.38 
 
 
387 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  54.64 
 
 
387 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1502  porin, interruption-N  89.03 
 
 
278 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980797  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  44.74 
 
 
386 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  44.74 
 
 
386 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.74 
 
 
436 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  44.74 
 
 
386 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  44.74 
 
 
386 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  44.74 
 
 
386 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  46.57 
 
 
383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  44.5 
 
 
386 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  44.01 
 
 
436 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  45.59 
 
 
380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  45.83 
 
 
380 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  44.33 
 
 
383 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  44.33 
 
 
383 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  45.83 
 
 
380 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  46.32 
 
 
383 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  44.33 
 
 
383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  44.58 
 
 
383 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  46.21 
 
 
374 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  44.61 
 
 
380 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  46.21 
 
 
374 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  46.21 
 
 
374 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  44.12 
 
 
385 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  45.52 
 
 
380 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  45.96 
 
 
374 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  43.87 
 
 
385 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  47.31 
 
 
374 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  44.61 
 
 
380 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  45.23 
 
 
381 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  45.52 
 
 
379 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  46.29 
 
 
384 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  46.29 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  46.29 
 
 
384 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  45.57 
 
 
379 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  45.57 
 
 
379 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  45.57 
 
 
379 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  45.98 
 
 
376 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  45.32 
 
 
379 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  45.98 
 
 
376 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  45.98 
 
 
376 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  45.98 
 
 
376 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  46.04 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  45.32 
 
 
379 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  46.04 
 
 
384 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  46.04 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  46.04 
 
 
384 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  43.2 
 
 
389 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  43.35 
 
 
381 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  43.49 
 
 
390 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  44.58 
 
 
381 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  43.86 
 
 
385 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  45.28 
 
 
389 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.64 
 
 
379 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  43.95 
 
 
381 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  46.72 
 
 
362 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  46.72 
 
 
362 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  46.72 
 
 
362 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  44.09 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  44.36 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  43.35 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  44.64 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  45.41 
 
 
372 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  44.07 
 
 
391 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  45.15 
 
 
372 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  44.55 
 
 
389 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  45.34 
 
 
380 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  44.2 
 
 
390 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  41.71 
 
 
391 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  45.71 
 
 
383 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  41.71 
 
 
409 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  41.71 
 
 
409 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  40.64 
 
 
383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  43.52 
 
 
383 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  46.55 
 
 
361 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  43.64 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  42.3 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  43.71 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  45.43 
 
 
380 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  43.72 
 
 
409 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  42.05 
 
 
384 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  41.91 
 
 
383 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  43.41 
 
 
390 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>