More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3252 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2243  radical SAM domain-containing protein  93.52 
 
 
386 aa  765    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0981  radical SAM domain-containing protein  93.52 
 
 
386 aa  765    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820842  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4131  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  88.68 
 
 
381 aa  708    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1963  radical SAM domain-containing protein  93.52 
 
 
386 aa  765    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4899  radical SAM family protein  80 
 
 
386 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152748  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3055  radical SAM domain-containing protein  93.52 
 
 
386 aa  765    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4719  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  96.11 
 
 
386 aa  784    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1287  radical SAM domain-containing protein  93.26 
 
 
371 aa  735    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0105  radical SAM oxidoreductase  94.96 
 
 
386 aa  764    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2244  radical SAM domain-containing protein  94.34 
 
 
371 aa  741    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7035  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  86.2 
 
 
384 aa  711    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000165617 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0017  MoaA/NifB/PqqE family protein  86.42 
 
 
384 aa  708    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5424  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  95.6 
 
 
386 aa  781    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3252  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  100 
 
 
386 aa  810    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4168  putative hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein  81.07 
 
 
388 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159717  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5307  radical SAM family protein  95.85 
 
 
386 aa  783    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2930  radical SAM domain-containing protein  93.52 
 
 
386 aa  765    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4877  radical SAM domain-containing protein  95.34 
 
 
386 aa  781    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481897  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5553  radical SAM domain-containing protein  95.85 
 
 
386 aa  783    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1268  radical SAM domain-containing protein  93.52 
 
 
386 aa  765    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1831  radical SAM domain-containing protein  69.51 
 
 
383 aa  585  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  69.87 
 
 
382 aa  578  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  69.38 
 
 
382 aa  564  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6342  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  68.1 
 
 
384 aa  548  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3658  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  65.21 
 
 
387 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3768  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  65.46 
 
 
387 aa  544  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3460  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  65.46 
 
 
387 aa  544  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  0.56 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0969  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  65.98 
 
 
387 aa  547  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  68.1 
 
 
384 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2971  hypothetical protein  63.8 
 
 
382 aa  538  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0553904  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0060  radical SAM family protein  66.76 
 
 
387 aa  537  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0850532  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1288  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  66.3 
 
 
392 aa  534  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2680  radical SAM family protein  63.51 
 
 
389 aa  525  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.150776  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2267  Fe-S oxidoreductase  63.24 
 
 
389 aa  522  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1725  radical SAM family protein  60.78 
 
 
383 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0670141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4256  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  62.89 
 
 
386 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.59824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3571  radical SAM family protein  62.16 
 
 
386 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22168  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1728  radical SAM family protein  62.16 
 
 
388 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.791785  normal  0.0366359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1745  oxidoreductase  65.23 
 
 
372 aa  495  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2115  radical SAM domain protein  62.3 
 
 
367 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1774  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  62.3 
 
 
367 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20630  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  59.09 
 
 
377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  61.74 
 
 
369 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0815  MoaA/NifB/PqqE family protein  60.29 
 
 
371 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.26 
 
 
338 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.26 
 
 
338 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2079  MoaA/NifB/PqqE family Fe-S oxidoreductase  52.69 
 
 
336 aa  409  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0826  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  58.02 
 
 
337 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.256838 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3361  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  57.1 
 
 
402 aa  403  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3457  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  59.75 
 
 
339 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1219  radical SAM family protein  58.02 
 
 
338 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0220  radical SAM family protein  57.32 
 
 
340 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1699  radical SAM domain-containing protein  54.33 
 
 
334 aa  391  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.440195  hitchhiker  0.000169379 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1015  radical SAM family Fe-S protein  54.01 
 
 
366 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0391907  normal  0.466336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4083  radical SAM domain-containing protein  57.89 
 
 
336 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6662  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  52.32 
 
 
334 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2595  radical SAM family protein  52.25 
 
 
332 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.90136  normal  0.0805169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0827  radical SAM family protein  49.25 
 
 
334 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.731351  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6192  radical SAM domain-containing protein  49.85 
 
 
332 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0225613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5711  radical SAM domain-containing protein  49.85 
 
 
335 aa  351  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23060  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  48.95 
 
 
334 aa  346  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.1711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0865  radical SAM domain-containing protein  42.27 
 
 
331 aa  302  8.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1017  radical SAM domain-containing protein  44.34 
 
 
332 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2823  radical SAM family protein  44.97 
 
 
332 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0411588 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2446  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  45.28 
 
 
336 aa  296  4e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0685  radical SAM domain-containing protein  44.65 
 
 
332 aa  295  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 
332 aa  295  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0882  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  43.71 
 
 
332 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000626988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2236  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  42.59 
 
 
333 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3363  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  43.71 
 
 
332 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3273  radical SAM domain-containing protein  52.31 
 
 
157 aa  146  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347908  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  27.65 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  23.84 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.01 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  26.14 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
393 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 
565 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.92 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  25 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.9 
 
 
323 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  25 
 
 
487 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  21.99 
 
 
326 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.52 
 
 
399 aa  64.3  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 
338 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 
406 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 
406 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  22.49 
 
 
404 aa  63.2  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  23.32 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  28.75 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 
399 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 
381 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  24.63 
 
 
491 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 
496 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 
501 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>