More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3145 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3089  AraC family transcriptional regulator  90.11 
 
 
363 aa  641  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  3.81417e-07  hitchhiker  0.0021619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6508  bifunctional DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  89.94 
 
 
363 aa  649  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  1.3299e-08  normal  0.0946299 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3145  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
365 aa  730  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.98948e-08  unclonable  6.12342e-12 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3205  AraC family transcriptional regulator  90.11 
 
 
380 aa  641  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  4.0374e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3152  AraC family transcriptional regulator  89.77 
 
 
363 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  4.75647e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2539  AraC family transcriptional regulator  89.77 
 
 
363 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  5.7895e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3171  AraC family transcriptional regulator  89.77 
 
 
363 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  7.19173e-08  decreased coverage  1.35353e-07 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0322  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  80.06 
 
 
364 aa  554  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  1.61378e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0115  ADA regulatory protein  80.06 
 
 
364 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  3.93468e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2249  ADA regulatory protein  80.06 
 
 
364 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  2.55362e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0132  ADA regulatory protein  80.06 
 
 
364 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2836  ADA regulatory protein  80.06 
 
 
364 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  9.94394e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2323  ADA regulatory protein  80.06 
 
 
364 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  1.61007e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2300  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  80.06 
 
 
364 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000121844  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0085  ADA regulatory protein  79.54 
 
 
364 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  9.11419e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0116  regulatory protein ada (regulatory protein of adaptative response)  79.77 
 
 
364 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  3.27978e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3088  AraC family transcriptional regulator  72.85 
 
 
376 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  1.18536e-07  hitchhiker  7.98373e-14 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3955  transcriptional regulator, AraC family  76.5 
 
 
391 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  1.56521e-05  normal  0.830157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4482  AraC family transcriptional regulator  75.22 
 
 
401 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.21745e-09  unclonable  1.5212e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0082  ada regulatory protein  47.21 
 
 
354 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4134  AraC family transcriptional regulator  46.92 
 
 
354 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0607807  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1027  transcriptional regulator, AraC family  48.27 
 
 
359 aa  328  1e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0793  transcriptional regulator, AraC family  48.27 
 
 
376 aa  326  4e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0138198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4835  transcriptional regulator, AraC family  51.01 
 
 
360 aa  325  8e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179003  normal  0.379038 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02140  fused DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  48.98 
 
 
354 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02099  hypothetical protein  48.98 
 
 
354 aa  324  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.592554  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2856  transcriptional regulator, AraC family  48.55 
 
 
361 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1445  transcriptional regulator, AraC family  48.69 
 
 
354 aa  323  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.29559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0727  regulatory protein Ada  48.4 
 
 
354 aa  322  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.166972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2352  regulatory protein Ada  48.69 
 
 
354 aa  322  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.970088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3351  regulatory protein Ada  48.4 
 
 
354 aa  322  5e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.212963  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1437  AraC family transcriptional regulator  48.4 
 
 
354 aa  322  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2362  regulatory protein Ada  48.4 
 
 
354 aa  322  8e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.960218  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0501  transcriptional regulator, AraC family  52.3 
 
 
374 aa  322  8e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2512  regulatory protein Ada  48.1 
 
 
354 aa  320  4e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0107303  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4239  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  49.28 
 
 
353 aa  318  7e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.577797  normal  0.120321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0740  AraC family transcriptional regulator  49.28 
 
 
350 aa  318  8e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0476  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  45.79 
 
 
361 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1042  AraC family transcriptional regulator  52.01 
 
 
370 aa  315  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.826547  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2450  transcriptional regulator, AraC family  48.26 
 
 
361 aa  315  1e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0383  ada regulatory protein  45.89 
 
 
361 aa  313  3e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2118  AraC family transcriptional regulator  46.2 
 
 
366 aa  311  8e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0669009  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0368  ada regulatory protein  45.61 
 
 
361 aa  311  8e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4477  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
350 aa  310  3e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0739  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  48.1 
 
 
350 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2938  AraC family transcriptional regulator  46.44 
 
 
357 aa  309  6e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2570  bifunctional methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase/O-6-methylguanine-DNA transcription regulator  49.12 
 
 
360 aa  309  6e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2505  regulatory protein ada  48.15 
 
 
352 aa  307  2e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  hitchhiker  0.000630655 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2449  regulatory protein ada  48.15 
 
 
352 aa  307  2e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0458356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2401  regulatory protein ada  47.86 
 
 
352 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00982046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0706  adaptive response regulator protein  48.1 
 
 
350 aa  306  4e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.998073  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2608  regulatory protein ada  47.86 
 
 
352 aa  306  5e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.669578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4931  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 
354 aa  306  5e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2491  regulatory protein ada  47.86 
 
 
353 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3765  bifunctional DNA-binding transcriptional dual regulator/O6-methylguanine-DNA methyltransferase  47.31 
 
 
354 aa  305  1e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1536  transcriptional regulator, AraC family  47.06 
 
 
366 aa  305  1e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.26366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3365  methylated-DNA-[protein]-cysteine S-methyltransferase  43.86 
 
 
384 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3753  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  50.29 
 
 
363 aa  295  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.2777  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3595  Ada regulatory protein  44.77 
 
 
368 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1307  transcriptional regulator, AraC family  48.98 
 
 
357 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0834  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  47.35 
 
 
340 aa  292  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2793  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  46.65 
 
 
354 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.986339  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1127  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  49.13 
 
 
351 aa  289  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.836162  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4318  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  50.75 
 
 
380 aa  289  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  47.26 
 
 
358 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37190  O6-methylguanine-DNA methyltransferase  47.85 
 
 
358 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320795  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4687  transcriptional regulator, AraC family  50.45 
 
 
361 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2282  AraC family transcriptional regulator  48.25 
 
 
345 aa  284  1e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2396  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  45.27 
 
 
343 aa  284  2e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3551  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
369 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0783013  normal  0.874169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1283  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  41.23 
 
 
344 aa  274  2e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46280  Methylated-DNA--(protein)-cysteine S-methyltransferase  47.31 
 
 
355 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6249  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  44.79 
 
 
388 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0991  methylated-DNA/protein- cysteinemethyltransferase  48.9 
 
 
295 aa  242  9e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.275505  normal  0.265908 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0076  adaptative response regulatory protein Ada  42.32 
 
 
273 aa  230  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2772  transcriptional regulator, AraC family  46.01 
 
 
313 aa  228  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353019  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2956  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  45.11 
 
 
303 aa  220  4e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1950  transcriptional regulator, AraC family  44.37 
 
 
338 aa  212  8e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0019  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  36.9 
 
 
360 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1108  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  33.82 
 
 
348 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  9.71871e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0128  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  36.23 
 
 
361 aa  201  2e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0045  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  36.89 
 
 
348 aa  201  2e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.218349  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1546  putative methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  37.93 
 
 
357 aa  197  2e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.939179  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2162  AraC family transcriptional regulator  46.35 
 
 
306 aa  196  4e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.235913  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3288  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  37.36 
 
 
351 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.575953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17760  putative methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  36.06 
 
 
357 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0889  ada regulatory protein, putative  36.09 
 
 
350 aa  190  3e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2682  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  36.34 
 
 
354 aa  190  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100688  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0833  putative ada regulatory protein  35.54 
 
 
350 aa  185  1e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0066  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  36.49 
 
 
357 aa  185  1e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  decreased coverage  0.00876972 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0849  ADA regulatory protein  33.24 
 
 
351 aa  184  2e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0286  hypothetical protein  32.26 
 
 
352 aa  179  6e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0450605 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0196  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  40.94 
 
 
282 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1152  hypothetical protein  33.24 
 
 
356 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1156  hypothetical protein  32.96 
 
 
356 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1745  methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase  31.3 
 
 
351 aa  175  1e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00607574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2158  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  33.63 
 
 
360 aa  174  2e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.267601  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0083  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  35.63 
 
 
358 aa  174  2e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.869567  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0234  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  34.78 
 
 
354 aa  174  2e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1438  methylated-DNA--protein- cysteinemethyltransferase  34.08 
 
 
357 aa  174  3e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>