86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3093 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 
263 aa  523  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  88.89 
 
 
263 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  89.27 
 
 
263 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  89.27 
 
 
263 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  88.89 
 
 
263 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  91.57 
 
 
263 aa  430  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  91.57 
 
 
263 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  85.84 
 
 
267 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  85.47 
 
 
267 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  85.41 
 
 
267 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  80.38 
 
 
267 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  85.41 
 
 
267 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  85.41 
 
 
267 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  85.41 
 
 
267 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  80 
 
 
252 aa  362  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  73.12 
 
 
267 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  72.33 
 
 
267 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  57.48 
 
 
281 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  55.31 
 
 
285 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  60 
 
 
287 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  55.07 
 
 
322 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  52.91 
 
 
334 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.22 
 
 
233 aa  175  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  46.43 
 
 
243 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  41.48 
 
 
212 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.39 
 
 
216 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  40.57 
 
 
241 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  36.41 
 
 
214 aa  112  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  34.78 
 
 
213 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  38.04 
 
 
215 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.14 
 
 
280 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  35.14 
 
 
229 aa  102  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  37.31 
 
 
238 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.84 
 
 
215 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  37.11 
 
 
215 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.16 
 
 
235 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.63 
 
 
248 aa  99.4  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  35.68 
 
 
250 aa  99  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.6 
 
 
215 aa  99  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.16 
 
 
237 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  35.61 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.51 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  32.97 
 
 
234 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  32.97 
 
 
234 aa  95.1  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.76 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.89 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  32.79 
 
 
220 aa  90.5  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.82 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.61 
 
 
221 aa  89  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.93 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.62 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  35.87 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.8 
 
 
243 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.5 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.5 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.39 
 
 
222 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  30.27 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.34 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  30 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.65 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  30.27 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  34.11 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  31.18 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  30.27 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.1 
 
 
240 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.37 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.81 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.05 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.05 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  28.51 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  24.77 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  28.87 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  30.49 
 
 
266 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 
272 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 
272 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  25.39 
 
 
216 aa  44.3  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  29.37 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 
272 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  31.07 
 
 
231 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  23.39 
 
 
225 aa  42  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  28.05 
 
 
272 aa  42  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>