More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2963 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_3015  porin  95.53 
 
 
358 aa  682  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  96.93 
 
 
358 aa  675  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  96.93 
 
 
358 aa  675  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  95.25 
 
 
358 aa  682  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  96.65 
 
 
358 aa  688  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  100 
 
 
358 aa  726  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  96.93 
 
 
358 aa  675  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  75.7 
 
 
358 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  75.98 
 
 
358 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  75.98 
 
 
358 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  75.98 
 
 
387 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  72.39 
 
 
367 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  72.1 
 
 
361 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  72.38 
 
 
361 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  54.2 
 
 
360 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  60.06 
 
 
356 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  50.82 
 
 
363 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  59.02 
 
 
356 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  55.52 
 
 
357 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  57.45 
 
 
352 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  57.45 
 
 
352 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  55.52 
 
 
357 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  55.59 
 
 
351 aa  352  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  48.78 
 
 
361 aa  307  1e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  47.79 
 
 
359 aa  305  1e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  45.45 
 
 
344 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  41.81 
 
 
365 aa  259  5e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  44.73 
 
 
344 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  44.54 
 
 
344 aa  244  2e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  42.41 
 
 
340 aa  222  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  40.54 
 
 
341 aa  210  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  44.13 
 
 
332 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  38.7 
 
 
362 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  39.7 
 
 
342 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  38.48 
 
 
341 aa  198  1e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  36.87 
 
 
357 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  36.87 
 
 
357 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  38.92 
 
 
340 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  36.19 
 
 
357 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  36.72 
 
 
357 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  36.72 
 
 
357 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  35.68 
 
 
386 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  35.68 
 
 
386 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  36.1 
 
 
386 aa  140  4e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  35.32 
 
 
386 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  35.32 
 
 
386 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  35.32 
 
 
386 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  34.45 
 
 
386 aa  136  6e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  33.61 
 
 
390 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  33.59 
 
 
383 aa  128  1e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  34.36 
 
 
359 aa  128  2e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  35.09 
 
 
361 aa  127  2e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  32.64 
 
 
383 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  34.26 
 
 
359 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  34.36 
 
 
359 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  3.61687e-05 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  33.88 
 
 
383 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  33.07 
 
 
352 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  33.79 
 
 
383 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  33.79 
 
 
383 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  33.33 
 
 
359 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  33.67 
 
 
400 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  33.79 
 
 
383 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  33.33 
 
 
395 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  33.61 
 
 
384 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  32.79 
 
 
389 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  33.15 
 
 
359 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  35.59 
 
 
394 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  32.98 
 
 
436 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  32.91 
 
 
400 aa  121  1e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  32.98 
 
 
386 aa  122  1e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  32.98 
 
 
386 aa  122  1e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  32.98 
 
 
386 aa  122  1e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  31.83 
 
 
381 aa  122  1e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  32.18 
 
 
436 aa  122  1e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  32.98 
 
 
386 aa  122  1e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  33.73 
 
 
376 aa  122  1e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  32.98 
 
 
386 aa  122  1e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  31.58 
 
 
359 aa  121  2e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  31.58 
 
 
359 aa  121  2e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  32.33 
 
 
338 aa  121  2e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  4.23032e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.06 
 
 
385 aa  121  2e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  32.16 
 
 
387 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  32.79 
 
 
385 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  32.15 
 
 
350 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  32.31 
 
 
394 aa  120  4e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  31.56 
 
 
389 aa  120  5e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  31.56 
 
 
389 aa  120  5e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  33.7 
 
 
393 aa  119  1e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  32.88 
 
 
344 aa  118  1e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  32.71 
 
 
386 aa  119  1e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  33.23 
 
 
350 aa  119  1e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  33.8 
 
 
389 aa  117  2e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  34.81 
 
 
376 aa  117  2e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  34.54 
 
 
376 aa  118  2e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  34.81 
 
 
376 aa  117  2e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  31.02 
 
 
357 aa  117  2e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  31.93 
 
 
357 aa  118  2e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  35.41 
 
 
403 aa  118  2e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  36.07 
 
 
379 aa  117  2e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  31.3 
 
 
389 aa  117  2e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.919602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>