More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2746 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
144 aa  285  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  80.56 
 
 
152 aa  233  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  77.37 
 
 
144 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  71.63 
 
 
142 aa  204  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  67.14 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  67.14 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  59.26 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 
143 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 
143 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 
143 aa  147  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 
143 aa  147  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  54.07 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  40.57 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
174 aa  60.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  30.83 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
168 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
170 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
174 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28.83 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
143 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
163 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
163 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
163 aa  50.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
164 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
162 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
142 aa  50.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  29.37 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  37.14 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  30.37 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  22.66 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 
139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  29.59 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  27.41 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
187 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>