More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2171 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  100 
 
 
297 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  96.63 
 
 
297 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  96.63 
 
 
297 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  96.63 
 
 
297 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  95.62 
 
 
297 aa  595  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  96.3 
 
 
297 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  96.3 
 
 
297 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  88.55 
 
 
297 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  88.55 
 
 
297 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  88.55 
 
 
297 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  88.89 
 
 
297 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  88.55 
 
 
297 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  88.55 
 
 
297 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  88.55 
 
 
297 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  88.55 
 
 
297 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  86.53 
 
 
297 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  85.86 
 
 
297 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  84.12 
 
 
297 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  65.44 
 
 
299 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  63.76 
 
 
299 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  64.65 
 
 
297 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  64.31 
 
 
297 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  63.19 
 
 
305 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  59.53 
 
 
321 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  60.14 
 
 
325 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  61.2 
 
 
321 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  60.47 
 
 
322 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  60.47 
 
 
322 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  59.12 
 
 
324 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  56.52 
 
 
325 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  56.52 
 
 
325 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  54.81 
 
 
342 aa  355  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  56.23 
 
 
322 aa  349  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  57.09 
 
 
262 aa  340  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  54.05 
 
 
322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  56.48 
 
 
268 aa  330  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  55 
 
 
268 aa  328  9e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  59.32 
 
 
262 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  49.83 
 
 
269 aa  287  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  58.01 
 
 
268 aa  285  9e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  50.17 
 
 
267 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  45.64 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  45.64 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  44 
 
 
274 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  45.73 
 
 
299 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  43.73 
 
 
298 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  41.59 
 
 
325 aa  228  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  44.22 
 
 
266 aa  228  8e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1067  signal peptidase I  40 
 
 
322 aa  228  9e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1203  signal peptidase I  41.19 
 
 
321 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.292281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  44.78 
 
 
263 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  42.33 
 
 
255 aa  226  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  44.03 
 
 
299 aa  225  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  51.35 
 
 
262 aa  223  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2786  signal peptidase I  41.79 
 
 
322 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0394004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  42.41 
 
 
270 aa  222  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  41.95 
 
 
305 aa  221  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  42.76 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  41.95 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  41.95 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02462  leader peptidase (signal peptidase I)  42.11 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1100  signal peptidase I  42.11 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00559358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2723  signal peptidase I  42.11 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0835548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2854  signal peptidase I  42.11 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168812  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  42.57 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1109  signal peptidase I  42.11 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.700104  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  42.11 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2721  signal peptidase I  42.11 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.010044  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3805  signal peptidase I  42.11 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0594788  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  44.55 
 
 
283 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  42.28 
 
 
305 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2245  signal peptidase I  44.81 
 
 
288 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3072  signal peptidase I  40.9 
 
 
321 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0190476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  40.74 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  43.54 
 
 
263 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  43.54 
 
 
263 aa  219  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  40.27 
 
 
305 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  44.04 
 
 
284 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  40.27 
 
 
305 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  43.54 
 
 
300 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  40.27 
 
 
305 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  40.27 
 
 
305 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  42.57 
 
 
284 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  42.57 
 
 
284 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  44.37 
 
 
284 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3055  signal peptidase I  39.65 
 
 
324 aa  215  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394235  normal  0.0107141 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3610  signal peptidase I  39.17 
 
 
332 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0291882  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  41.81 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  43.71 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  41.08 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1188  signal peptidase I  39.17 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.234081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  43.62 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  43.71 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1135  signal peptidase I  38.87 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0055929  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  43.71 
 
 
284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  40.27 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  43.71 
 
 
284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  40.74 
 
 
305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  45.56 
 
 
256 aa  212  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  39.39 
 
 
304 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>