More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2126 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2126  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
346 aa  708    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330362  normal  0.517633 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2788  AraC family transcriptional regulator  92.65 
 
 
345 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1738  AraC family transcriptional regulator  92.35 
 
 
345 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2428  AraC family transcriptional regulator  92.35 
 
 
345 aa  644    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0590  AraC family transcriptional regulator  92.35 
 
 
345 aa  644    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.988044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2849  AraC family transcription regulator  92.42 
 
 
348 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1060  AraC family transcriptional regulator  96.57 
 
 
321 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1178  AraC family transcriptional regulator  97.4 
 
 
346 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2863  AraC family transcriptional regulator  92.13 
 
 
348 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  97.09 
 
 
347 aa  690    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1156  AraC family transcriptional regulator  97.4 
 
 
346 aa  695    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.131612 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1774  AraC family transcriptional regulator  93.82 
 
 
347 aa  654    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0699  AraC family transcriptional regulator  97.4 
 
 
346 aa  695    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1057  AraC family transcriptional regulator  96.82 
 
 
346 aa  693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0171524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2729  AraC family transcription regulator  92.65 
 
 
345 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1788  AraC family transcriptional regulator  89.34 
 
 
350 aa  631  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432014  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1557  transcriptional regulator, AraC family  88.08 
 
 
349 aa  625  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150137  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2924  AraC family transcriptional regulator  88.08 
 
 
349 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817827  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 
367 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 
367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  39.87 
 
 
364 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4482  AraC family transcriptional regulator  54.95 
 
 
326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1433  helix-turn-helix domain-containing protein  54.95 
 
 
326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.392956  normal  0.582162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3771  AraC family transcriptional regulator  51.23 
 
 
326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128178  normal  0.013148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3987  AraC family transcriptional regulator  53.6 
 
 
326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 
353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1831  transcriptional regulator ArgR  54.55 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3566  helix-turn-helix, AraC type  54.55 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139016  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34510  ArgR-like transcriptional regulator, AraC family  50.64 
 
 
324 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  39.54 
 
 
367 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
339 aa  229  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
368 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  41.23 
 
 
319 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
368 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  41.23 
 
 
315 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52740  transcriptional regulator ArgR  50.61 
 
 
329 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  39.22 
 
 
367 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
368 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  38.89 
 
 
367 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4621  transcriptional regulator ArgR  50.61 
 
 
329 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
368 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  37.38 
 
 
375 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
315 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 
344 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  39.94 
 
 
324 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4287  AraC family transcriptional regulator  53.15 
 
 
326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  37.46 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2912  AraC family transcriptional regulator  54.29 
 
 
326 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299019 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 
337 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  37.1 
 
 
337 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 
334 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
337 aa  215  8e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  36.39 
 
 
334 aa  215  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  36.76 
 
 
343 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 
343 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  39.63 
 
 
322 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  39.68 
 
 
325 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  38.78 
 
 
317 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  38.49 
 
 
341 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  36.66 
 
 
344 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 
314 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  38.51 
 
 
314 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  35.74 
 
 
339 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
336 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  39.47 
 
 
336 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  35.42 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
401 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  39.67 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 
336 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 
361 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 
361 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 
332 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  38.69 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  35.6 
 
 
339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  38.69 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  38.69 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
332 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  36.77 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4823  transcriptional regulator  37.15 
 
 
338 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  37.22 
 
 
341 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 
330 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
331 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  36.93 
 
 
334 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2064  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
335 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405224  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  39.67 
 
 
314 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  39.67 
 
 
314 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3665  AraC family transcriptional regulator  39.35 
 
 
401 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  normal  0.253179 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 
332 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2234  AraC family transcriptional regulator  39.41 
 
 
335 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.498713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
340 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4893  AraC family transcriptional regulator  35.39 
 
 
340 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  36.66 
 
 
332 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  36.66 
 
 
355 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>