More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2085 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 
423 aa  852    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  88.97 
 
 
447 aa  725    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  88.97 
 
 
426 aa  765    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  89.44 
 
 
426 aa  733    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  90 
 
 
426 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  89.44 
 
 
426 aa  733    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  90 
 
 
426 aa  696    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  61.79 
 
 
427 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  64.32 
 
 
403 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  64.32 
 
 
403 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  61.32 
 
 
427 aa  509  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  55.66 
 
 
424 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  56.12 
 
 
440 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  54.72 
 
 
446 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  67.23 
 
 
474 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  67.23 
 
 
474 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  67.23 
 
 
482 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  35.57 
 
 
427 aa  250  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  34.99 
 
 
419 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  34.64 
 
 
441 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  38.68 
 
 
428 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  38.15 
 
 
428 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  39.1 
 
 
464 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  38.17 
 
 
428 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  38.42 
 
 
428 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  38.42 
 
 
428 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  38.42 
 
 
428 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  38.67 
 
 
429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  38.85 
 
 
464 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  38.85 
 
 
515 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  38.01 
 
 
425 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  38.68 
 
 
423 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  38.66 
 
 
422 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  39.76 
 
 
424 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  37.81 
 
 
428 aa  231  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  36.36 
 
 
429 aa  224  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  30.02 
 
 
428 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  37.56 
 
 
436 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  37.31 
 
 
436 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  36.43 
 
 
424 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  36.43 
 
 
424 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  36.68 
 
 
424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  36.68 
 
 
424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  36.68 
 
 
424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  35.93 
 
 
424 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  35.59 
 
 
422 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  35.59 
 
 
424 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  36.43 
 
 
424 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  35.59 
 
 
422 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  35.59 
 
 
424 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  37.03 
 
 
424 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  35.34 
 
 
424 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  35.34 
 
 
422 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  35.34 
 
 
422 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  34.81 
 
 
411 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.72 
 
 
790 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  30.83 
 
 
421 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.25 
 
 
777 aa  186  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.16 
 
 
780 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  26.46 
 
 
413 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  28.82 
 
 
414 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2032  EAL domain protein  33.46 
 
 
396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  29.87 
 
 
416 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000198  EAL domain protein  32.23 
 
 
262 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000396049  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0662  putative signaling protein  30.86 
 
 
266 aa  129  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260634  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05954  hypothetical protein  32.82 
 
 
272 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1754  diguanylate phosphodiesterase  30.81 
 
 
431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000218  diguanylate phosphodiesterase  32.64 
 
 
272 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1867  hypothetical protein  35.88 
 
 
582 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145916  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0470  hypothetical protein  33.83 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129901  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  30.04 
 
 
362 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21870  EAL domain/GGDEF domain-containing protein  35.8 
 
 
601 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.220571  hitchhiker  0.00056029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.84 
 
 
572 aa  117  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  30.49 
 
 
360 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.82 
 
 
584 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00692574  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51660  EAL/GGDEF domain-containing protein  33.33 
 
 
592 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1949  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.02 
 
 
773 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.86 
 
 
590 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0612  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 
197 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0617  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.05 
 
 
883 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00427205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.44 
 
 
766 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0058  diguanylate phosphodiesterase  35.34 
 
 
357 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4001  diguanylate phosphodiesterase  30.96 
 
 
357 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00838727  normal  0.748991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1718  diguanylate phosphodiesterase  30.96 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0187822  normal  0.029577 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0731  diguanylate phosphodiesterase  24.9 
 
 
263 aa  109  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1194  hypothetical protein  29.62 
 
 
284 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.603137  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1678  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.19 
 
 
596 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.684126  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  29.69 
 
 
584 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  29 
 
 
584 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0554  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29 
 
 
584 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111263  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3886  EAL domain/GGDEF domain protein  33.92 
 
 
590 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00288669  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.33 
 
 
605 aa  107  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.41 
 
 
585 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.41 
 
 
584 aa  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2042  diguanylate phosphodiesterase  32.44 
 
 
352 aa  106  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.41 
 
 
585 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3754  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.41 
 
 
585 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000868734  normal  0.0557959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.41 
 
 
583 aa  106  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4854  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.38 
 
 
594 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.26 
 
 
656 aa  106  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.574957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>