289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2008 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  85.41 
 
 
467 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  100 
 
 
467 aa  934    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  87.15 
 
 
467 aa  795    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  85.62 
 
 
467 aa  793    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  81.8 
 
 
475 aa  749    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  58.6 
 
 
553 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  59 
 
 
553 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  59.07 
 
 
575 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  59.07 
 
 
575 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  58.72 
 
 
552 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  58.76 
 
 
549 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  57.92 
 
 
554 aa  528  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  57.2 
 
 
553 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  57.2 
 
 
553 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  57.2 
 
 
553 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  56.65 
 
 
551 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  54.45 
 
 
550 aa  505  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  57.61 
 
 
537 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  55.21 
 
 
545 aa  503  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  56.21 
 
 
552 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  57.23 
 
 
545 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  57.02 
 
 
545 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  55.44 
 
 
558 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  56.82 
 
 
545 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  56.08 
 
 
552 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  55.35 
 
 
547 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  55.08 
 
 
549 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  54.49 
 
 
549 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  55.33 
 
 
553 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  54.45 
 
 
546 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  55.13 
 
 
552 aa  481  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  53.75 
 
 
556 aa  481  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  52.69 
 
 
538 aa  476  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  53.05 
 
 
548 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  55.9 
 
 
566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  53.99 
 
 
556 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  45.81 
 
 
570 aa  435  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  53.19 
 
 
463 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  52.67 
 
 
456 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  52.62 
 
 
464 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  54.29 
 
 
464 aa  412  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  52.19 
 
 
455 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  52.4 
 
 
471 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  51.92 
 
 
518 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  50.66 
 
 
448 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  48.5 
 
 
507 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  40.96 
 
 
412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  37.47 
 
 
418 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 
421 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  42.97 
 
 
413 aa  291  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  41.42 
 
 
424 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  37.21 
 
 
411 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  40.58 
 
 
424 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  38.54 
 
 
424 aa  253  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  40.72 
 
 
406 aa  250  5e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  36.19 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  36.97 
 
 
397 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  34 
 
 
442 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
453 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 
453 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  32.31 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  35.03 
 
 
938 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  30.25 
 
 
418 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 
425 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  29.95 
 
 
419 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  31.7 
 
 
432 aa  150  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  28.57 
 
 
391 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.27 
 
 
421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  30.08 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 
421 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
411 aa  137  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
415 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  28.07 
 
 
412 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 
416 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
434 aa  134  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
465 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  28.27 
 
 
410 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  39.02 
 
 
679 aa  129  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  26.54 
 
 
455 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.03 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 
421 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  28.17 
 
 
410 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.09 
 
 
412 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  27.01 
 
 
454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 
407 aa  127  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  28.13 
 
 
412 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  29.64 
 
 
438 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.87 
 
 
402 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.87 
 
 
402 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  25.73 
 
 
408 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
407 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  29.27 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  28.57 
 
 
402 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  28.85 
 
 
404 aa  120  6e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  28.57 
 
 
402 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  28.3 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  28.3 
 
 
402 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>