More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1968 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1968  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
348 aa  697    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.83471 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0380  AraC family transcriptional regulator  36.12 
 
 
344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1830  Fis family transcriptional regulator  31.21 
 
 
348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.733029  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2068  AraC family transcriptional regulator  31.77 
 
 
339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1480  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 
347 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1336  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 
336 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1344  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 
336 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2886  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 
347 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4375  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
345 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.987701  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  28.98 
 
 
345 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  26.05 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2222  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844007  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  26.05 
 
 
335 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5500  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2200  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5894  AraC family transcriptional regulator  28.13 
 
 
345 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2183  AraC family transcriptional regulator  28.13 
 
 
345 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 
352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
343 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4573  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 
342 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5769  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 
341 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
364 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 
357 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 
330 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
355 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  27.25 
 
 
339 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 
356 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 
351 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
356 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6100  putative transcriptional regulator  27.24 
 
 
356 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.177134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70290  putative transcriptional regulator  27.24 
 
 
356 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 
332 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 
360 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2100  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
247 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 
360 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 
356 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 
376 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 
341 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 
360 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 
340 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0477  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
366 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 
336 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  27.48 
 
 
330 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  24.35 
 
 
359 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 
382 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
343 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  26.35 
 
 
339 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66530  putative transcriptional regulator  29.24 
 
 
357 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  26.36 
 
 
347 aa  99.4  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2722  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 
350 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0191  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 
350 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.211144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  27.16 
 
 
330 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0996  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 
350 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0219  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 
350 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1560  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 
350 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2578  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 
350 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1365  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 
350 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.884424  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 
341 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 
330 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 
335 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  23.91 
 
 
345 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1759  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 
338 aa  93.2  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.206949  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.84 
 
 
343 aa  92.8  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 
398 aa  92.8  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5752  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207645  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0166  helix-turn-helix domain-containing protein  27.65 
 
 
368 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4528  helix-turn-helix domain-containing protein  25.93 
 
 
345 aa  89.7  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  24.84 
 
 
337 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11424  transcriptional regulator  24.55 
 
 
344 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.91456e-22  normal  0.0846378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  25.7 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  25 
 
 
390 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2956  AraC family transcriptional regulator  26.84 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1224  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 
335 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517703  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  28.7 
 
 
337 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29180  AraC family transcriptional regulator  25.24 
 
 
339 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3981  putative transcriptional regulator  25.16 
 
 
339 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  28.61 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  25.23 
 
 
396 aa  85.9  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  22.59 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0747  transcriptional regulator, AraC family  29.73 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40849  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0045  helix-turn-helix domain-containing protein  29.28 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  26.28 
 
 
346 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  26.79 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  26.81 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3167  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  24.53 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 
337 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3231  helix-turn-helix domain-containing protein  26.15 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5539  AraC family transcriptional regulator  23.1 
 
 
364 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  27.53 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>