More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1955 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  100 
 
 
476 aa  946    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  64.58 
 
 
479 aa  548  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  66.45 
 
 
482 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  66.38 
 
 
482 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  66.38 
 
 
479 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  66.38 
 
 
479 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  66.38 
 
 
482 aa  541  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  66.38 
 
 
471 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  66.01 
 
 
471 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  41.72 
 
 
488 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  38.72 
 
 
452 aa  282  8.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  42.02 
 
 
462 aa  279  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  37.55 
 
 
485 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  41.09 
 
 
472 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  41.18 
 
 
471 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  34.09 
 
 
495 aa  212  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  34.62 
 
 
488 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5155  outer membrane efflux protein  35.16 
 
 
481 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239334  normal  0.865316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5005  outer membrane efflux protein  35.4 
 
 
485 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.844775 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  33.01 
 
 
528 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 
738 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1789  outer membrane efflux protein  35.19 
 
 
493 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  28.44 
 
 
508 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  28.44 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  28.44 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  31.15 
 
 
521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  31.22 
 
 
515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  31.46 
 
 
519 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  27.3 
 
 
476 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  27.3 
 
 
476 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  29.08 
 
 
514 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  29.08 
 
 
514 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  29.08 
 
 
514 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  29.6 
 
 
514 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  28.24 
 
 
509 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  29.35 
 
 
508 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  31.68 
 
 
513 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  28.83 
 
 
496 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  28.83 
 
 
496 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  27.86 
 
 
520 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  27.57 
 
 
527 aa  115  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1858  outer membrane efflux protein  31.32 
 
 
490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.514737  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1943  outer membrane efflux protein  30.79 
 
 
490 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  27.02 
 
 
576 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 
441 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  24.13 
 
 
497 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 
427 aa  103  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  25.55 
 
 
489 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  25.55 
 
 
489 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  25.55 
 
 
489 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  25.55 
 
 
489 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  25.55 
 
 
489 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.1 
 
 
442 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2020  outer membrane efflux protein  30.08 
 
 
492 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  24.26 
 
 
494 aa  96.7  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  24.15 
 
 
464 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  24.15 
 
 
464 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.32 
 
 
452 aa  95.9  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  25.32 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  27.59 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 
419 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  26.27 
 
 
472 aa  94.4  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 
435 aa  94.4  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 
443 aa  93.6  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 
419 aa  91.3  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.95 
 
 
480 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  22.55 
 
 
470 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.82 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  25 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  24.15 
 
 
493 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 
420 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  24.15 
 
 
493 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.15 
 
 
493 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  24.15 
 
 
493 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  24.15 
 
 
493 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
441 aa  87.8  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  24.15 
 
 
495 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  24.15 
 
 
495 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.45 
 
 
463 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  24.15 
 
 
493 aa  87  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  23.9 
 
 
495 aa  87  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.81 
 
 
553 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.05 
 
 
477 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 
423 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.89 
 
 
512 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 
426 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 
635 aa  85.9  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.07 
 
 
442 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.95 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2321  putative secretion protein  30.69 
 
 
461 aa  84.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 
565 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  25.36 
 
 
424 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.63 
 
 
491 aa  83.2  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.82 
 
 
494 aa  82.4  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  23.49 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  25.39 
 
 
503 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  25.25 
 
 
500 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.74 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>