177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1840 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  100 
 
 
270 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  37.86 
 
 
256 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  37.04 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  33.46 
 
 
292 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  37.68 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  31.67 
 
 
237 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  31.28 
 
 
233 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  31.25 
 
 
237 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  31.28 
 
 
233 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  31.28 
 
 
233 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  30.86 
 
 
259 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  31.34 
 
 
244 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  29.46 
 
 
240 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  29.05 
 
 
240 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  31.43 
 
 
244 aa  99  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  30.8 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  28.51 
 
 
230 aa  96.3  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  29.66 
 
 
229 aa  93.6  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  30.4 
 
 
225 aa  92.8  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  26.67 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  29.34 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  25.83 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.85 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  26.53 
 
 
243 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  30.96 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  26.46 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  26.46 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  31.09 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.16 
 
 
222 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  28.64 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  28.93 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  26.27 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  27.31 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  27.62 
 
 
219 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  25.76 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  28.1 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  27.43 
 
 
251 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  26.29 
 
 
219 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  25.32 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  29.03 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  24.59 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  27.8 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2054  putative phage repressor  27.49 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000034182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2091  peptidase S24 S26A and S26B  27.49 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000399055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.62 
 
 
212 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  34.31 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  31.39 
 
 
230 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  27.67 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  27.17 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  50 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  24.48 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  32.35 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  27.31 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  27.68 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  26.23 
 
 
239 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  25.21 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3896  Cro/CI family transcriptional regulator  22.22 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  24.66 
 
 
211 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  43.75 
 
 
220 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  27.1 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  25.13 
 
 
218 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  23.24 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  33.1 
 
 
193 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  29.59 
 
 
216 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  42.62 
 
 
71 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  25.51 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  25.96 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  26.24 
 
 
209 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  27.14 
 
 
209 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  31.4 
 
 
216 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4243  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
229 aa  55.8  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  23.43 
 
 
205 aa  55.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  33.33 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  25.51 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  21.88 
 
 
209 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0805  conserved hypothetical protein, putative peptidase S24  28.74 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  21.88 
 
 
209 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  38.98 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  23.73 
 
 
204 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  27 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  24.18 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  26.32 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  26.03 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  24.29 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  25.11 
 
 
245 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  25.11 
 
 
245 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  49.15 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  25.96 
 
 
205 aa  51.2  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  23.77 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  26.78 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  23.18 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 
210 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2925  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.82 
 
 
114 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000036816  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  48.15 
 
 
111 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  23.83 
 
 
229 aa  50.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  28.69 
 
 
263 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  24.08 
 
 
233 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  35.38 
 
 
218 aa  49.3  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 
255 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>