More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1778 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 156 aa  314  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  98.72 
 
 		 156 aa  310  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  98.72 
 
 		 156 aa  310  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  98.72 
 
 		 156 aa  310  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  98.72 
 
 		 156 aa  310  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  98.08 
 
 		 156 aa  309  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  98.08 
 
 		 156 aa  309  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  94.87 
 
 		 156 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  94.87 
 
 		 156 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  94.87 
 
 		 156 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  94.87 
 
 		 156 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  94.87 
 
 		 156 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  94.87 
 
 		 156 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  94.23 
 
 		 156 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  94.23 
 
 		 156 aa  300  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  93.59 
 
 		 156 aa  298  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  92.31 
 
 		 156 aa  298  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2755  translation initiation factor IF-3  91.67 
 
 		 156 aa  296  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  83.33 
 
 		 178 aa  266  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  81.82 
 
 		 154 aa  263  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  78.85 
 
 		 173 aa  257  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  77.42 
 
 		 169 aa  251  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  74.19 
 
 		 155 aa  245  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2002  translation initiation factor 3  74.67 
 
 		 153 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  73.55 
 
 		 184 aa  240  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1009  translation initiation factor IF-3  76.13 
 
 		 169 aa  239  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  72.9 
 
 		 173 aa  235  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  68.59 
 
 		 173 aa  226  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  67.31 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  66.67 
 
 		 174 aa  224  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  67.31 
 
 		 179 aa  223  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  75.37 
 
 		 137 aa  218  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1871  translation initiation factor IF-3  66.23 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4615  translation initiation factor IF-3  69.87 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.550189  hitchhiker  0.00733617 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1449  translation initiation factor IF-3  70.51 
 
 		 178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2399  translation initiation factor 3  70.51 
 
 		 205 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  62.58 
 
 		 172 aa  209  9e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1887  translation initiation factor 3  69.87 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729735  normal  0.011077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  62.58 
 
 		 166 aa  209  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000466118  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1337  translation initiation factor IF-3  66.67 
 
 		 171 aa  208  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  64.1 
 
 		 178 aa  208  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  64.1 
 
 		 178 aa  207  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  68.79 
 
 		 180 aa  207  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000676935  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  68.79 
 
 		 180 aa  207  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  62.18 
 
 		 183 aa  207  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1914  translation initiation factor IF-3  68.79 
 
 		 180 aa  207  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.223345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  62.18 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  62.18 
 
 		 183 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  62.18 
 
 		 183 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  62.18 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2181  translation initiation factor IF-3  69.43 
 
 		 180 aa  204  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0268784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1952  translation initiation factor IF-3  69.43 
 
 		 180 aa  204  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.26259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1889  translation initiation factor IF-3  69.43 
 
 		 180 aa  204  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2052  translation initiation factor IF-3  68.79 
 
 		 180 aa  201  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0593383  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  60.26 
 
 		 171 aa  199  9.999999999999999e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  59.09 
 
 		 182 aa  199  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000264089  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  61.54 
 
 		 185 aa  198  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  61.69 
 
 		 190 aa  198  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2379  translation initiation factor IF-3  62.18 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0845211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2163  translation initiation factor IF-3  62.18 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000118732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1932  translation initiation factor IF-3  62.18 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00133999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  59.62 
 
 		 177 aa  197  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1141  initiation factor 3  65.79 
 
 		 152 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28660  translation initiation factor IF-3  60.26 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  58.55 
 
 		 202 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1725  translation initiation factor IF-3  70.83 
 
 		 144 aa  193  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00587564  normal  0.500746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2505  translation initiation factor IF-3  59.62 
 
 		 177 aa  192  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1977  translation initiation factor IF-3  57.69 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269445  normal  0.0568676 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  54.84 
 
 		 194 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1713  translation initiation factor IF-3  66.25 
 
 		 183 aa  191  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000356147  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  55.48 
 
 		 194 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  54.84 
 
 		 194 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01687  translation initiation factor IF-3  68.75 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00539573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2436  translation initiation factor IF-3  68.75 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000110655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1429  translation initiation factor IF-3  68.75 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00177736  hitchhiker  0.00888747 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1960  translation initiation factor IF-3  68.75 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234201  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1839  translation initiation factor IF-3  68.75 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057261  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1473  translation initiation factor IF-3  68.75 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000416491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1799  translation initiation factor IF-3  68.75 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017178  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2011  translation initiation factor IF-3  68.75 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.727215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1445  translation initiation factor IF-3  68.75 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0313674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1936  translation initiation factor IF-3  68.75 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150093  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1462  translation initiation factor IF-3  68.75 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2185  translation initiation factor IF-3  64.52 
 
 		 180 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000180897  normal  0.0386823 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2221  translation initiation factor IF-3  64.52 
 
 		 180 aa  189  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000103984  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  58.71 
 
 		 163 aa  188  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  60.84 
 
 		 144 aa  189  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  63.08 
 
 		 137 aa  187  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0767  translation initiation factor 3  62.33 
 
 		 146 aa  186  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  56.29 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2490  translation initiation factor IF-3  62.58 
 
 		 180 aa  185  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000196048  hitchhiker  0.0000835818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1746  initiation factor 3  71.64 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00682554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  53.59 
 
 		 174 aa  184  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  56.34 
 
 		 173 aa  184  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2262  translation initiation factor IF-3  63.23 
 
 		 158 aa  183  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000757605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  54.19 
 
 		 159 aa  183  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 		 176 aa  183  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2031  translation initiation factor IF-3  63.87 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250222  hitchhiker  0.0000245728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  54.93 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>