More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1682 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_1682  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 238 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  95.38 
 
 		 238 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  95.38 
 
 		 238 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1526  GntR domain-containing protein  96.22 
 
 		 238 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.72314 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4692  GntR family transcriptional regulator  95.8 
 
 		 238 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468803  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1070  GntR-like  96.22 
 
 		 238 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1550  GntR domain-containing protein  96.22 
 
 		 238 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1259  GntR family transcriptional regulator  79.75 
 
 		 237 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.268862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1974  GntR family transcriptional regulator  79.75 
 
 		 237 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1821  GntR family transcriptional regulator  79.75 
 
 		 237 aa  362  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1016  GntR family transcriptional regulator  79.75 
 
 		 237 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1742  GntR family transcriptional regulator  79.75 
 
 		 237 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0150  GntR family transcriptional regulator  79.75 
 
 		 237 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0405244  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2512  GntR family transcriptional regulator  74.9 
 
 		 239 aa  349  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.109373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1725  GntR domain protein  73.86 
 
 		 241 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1667  GntR domain-containing protein  74.55 
 
 		 248 aa  341  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0248117 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2515  GntR family transcriptional regulator  80.17 
 
 		 237 aa  340  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0149634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1804  GntR family transcriptional regulator  80.17 
 
 		 237 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4715  GntR domain protein  42.54 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2976  GntR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3101  GntR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.161645  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2284  GntR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 439 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1325  GntR family regulatory protein  43.13 
 
 		 379 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.941808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  33.89 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  37.27 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  35.03 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  32.88 
 
 		 248 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  34.33 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  37.32 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  34.58 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  34.8 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  35.32 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5052  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  33.17 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  33.51 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  33.18 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  35.14 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  30.36 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  31.37 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  30.04 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  31.71 
 
 		 252 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  33.49 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  28.08 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  31.54 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  35.92 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  30.69 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  30.69 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  30.94 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  30.69 
 
 		 229 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  33.33 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  32.2 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.37 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  30.37 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  33.64 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  30.37 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  30.37 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  30.37 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  30.37 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  30.37 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  32.21 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  30.37 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2616  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 261 aa  95.5  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  29.52 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 192 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  33.33 
 
 		 192 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 192 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1760  GntR domain protein  29.31 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  30.2 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  29.07 
 
 		 266 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  26.67 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  26.67 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000012685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  26.67 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0632  GntR domain-containing protein  34.52 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  26.67 
 
 		 230 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1899  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.671252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>