More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1430 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
145 aa  289  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  81.54 
 
 
132 aa  224  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  81.54 
 
 
132 aa  224  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  81.54 
 
 
132 aa  224  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  85.6 
 
 
132 aa  224  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  83.45 
 
 
144 aa  223  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  80.77 
 
 
132 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  80.77 
 
 
132 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  80.77 
 
 
132 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  80.77 
 
 
132 aa  221  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  88.37 
 
 
144 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  85.93 
 
 
144 aa  220  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  87.79 
 
 
144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  87.6 
 
 
144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  87.79 
 
 
144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  72.92 
 
 
148 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  71.83 
 
 
152 aa  208  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  82.54 
 
 
132 aa  196  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  72 
 
 
129 aa  179  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  69.42 
 
 
133 aa  178  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  69.35 
 
 
152 aa  175  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  63.87 
 
 
132 aa  169  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  61.6 
 
 
128 aa  166  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  61.98 
 
 
128 aa  164  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  61.48 
 
 
128 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  63.56 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  61.48 
 
 
128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  61.48 
 
 
128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  61.48 
 
 
128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  59.17 
 
 
125 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  63.64 
 
 
299 aa  157  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  61.48 
 
 
138 aa  155  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  58.54 
 
 
125 aa  155  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  70.18 
 
 
109 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  78.35 
 
 
110 aa  151  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  70.3 
 
 
123 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.995495 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  58.68 
 
 
138 aa  142  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  68.04 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.333736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  54.17 
 
 
131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  56.67 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  54.24 
 
 
275 aa  136  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  56.14 
 
 
260 aa  133  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  48.41 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  59.05 
 
 
261 aa  124  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.42 
 
 
127 aa  123  7e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  49.17 
 
 
295 aa  123  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.67 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  49.11 
 
 
122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  50.52 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.68 
 
 
129 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  41.6 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  40.65 
 
 
392 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  40.65 
 
 
396 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2061  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.98 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4316  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.8 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146371  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  41.59 
 
 
133 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  40.71 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5750  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.22 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3125  carboxymuconolactone decarboxylase  36.22 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.61 
 
 
393 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5109  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.22 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2249  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  38.58 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0833929  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3162  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 
128 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.71 
 
 
130 aa  84.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 
128 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  39.56 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.32 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  35.54 
 
 
380 aa  84.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0050  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.51 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.21 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.53 
 
 
122 aa  84  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1557  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
128 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0060  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
128 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0058  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
128 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161595  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1487  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
128 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1204  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 
128 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  43.62 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
125 aa  83.6  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0071  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.92 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.09 
 
 
393 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.66 
 
 
402 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.09 
 
 
393 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  38.05 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.09 
 
 
393 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0830  carboxymuconolactone decarboxylase  44.57 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.09 
 
 
393 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.09 
 
 
393 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2734  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.59 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.888805  hitchhiker  0.0000628107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.17 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
363 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4461  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.273934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0647  4-carboxymuconolactone decarboxylase (PcaC)  36 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.153527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.82 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.9 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.82 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2291  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.29 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.210071  normal  0.0104298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4074  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.3 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>