More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1353 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  71.21 
 
 
454 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1353  major facilitator transporter  100 
 
 
448 aa  880    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.418078 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5312  major facilitator superfamily MFS_1  67.63 
 
 
458 aa  608  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1368  major facilitator superfamily MFS_1  71.75 
 
 
439 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00531865  normal  0.175653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1432  major facilitator superfamily MFS_1  70.98 
 
 
439 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.528546  normal  0.24074 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4515  major facilitator transporter  69.63 
 
 
454 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3938  major facilitator transporter  74.03 
 
 
456 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.718892  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4030  DNA-cytosine methyltransferase  67.48 
 
 
455 aa  565  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1618  major facilitator transporter  63.26 
 
 
458 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6028  major facilitator transporter  57.69 
 
 
452 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5784  major facilitator transporter  57.69 
 
 
452 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  56.68 
 
 
450 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1099  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  56.79 
 
 
461 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863734  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  56.81 
 
 
450 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5941  hypothetical protein  57.69 
 
 
456 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00787806  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7161  major facilitator transporter  58.28 
 
 
456 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6046  major facilitator transporter  58.64 
 
 
446 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08630  benzoate transporter  57.04 
 
 
443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2637  major facilitator superfamily MFS_1  54.79 
 
 
455 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  54.78 
 
 
451 aa  435  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  55.74 
 
 
446 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3587  major facilitator transporter  52.39 
 
 
445 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  49.2 
 
 
454 aa  421  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2706  major facilitator transporter  54.13 
 
 
440 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.300526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3165  major facilitator transporter  53.71 
 
 
442 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2684  major facilitator transporter  53.71 
 
 
442 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2550  major facilitator transporter  53.71 
 
 
442 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  44.16 
 
 
451 aa  346  4e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1181  major facilitator transporter  47.53 
 
 
443 aa  342  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.383013  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  42.41 
 
 
446 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  44.02 
 
 
446 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  44.72 
 
 
446 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3052  benzoate MFS transporter  36.32 
 
 
452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2281  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 
450 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1856  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 
435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4906  putative benzoate transport protein  36.95 
 
 
433 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0412  putative benzoate transport protein  36.95 
 
 
433 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0344  major facilitator transporter  36.95 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0464  benzoate transport protein, putative  36.7 
 
 
433 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0398  putative benzoate transport protein  36.67 
 
 
433 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0460  putative benzoate transport protein  36.7 
 
 
433 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0349  benzoate transport protein  36.7 
 
 
436 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0364  benzoate transport protein  36.7 
 
 
433 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0335  sugar transporter; benzoate transport protein  36.45 
 
 
436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0340  major facilitator transporter  36.82 
 
 
436 aa  243  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  37.08 
 
 
453 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  37.32 
 
 
452 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  37.32 
 
 
452 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  34.98 
 
 
454 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  37.32 
 
 
453 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  34.34 
 
 
442 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  36.19 
 
 
437 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  36.75 
 
 
453 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4077  4-hydroxybenzoate transporter  34.26 
 
 
475 aa  236  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0892005  normal  0.387821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3370  major facilitator transporter  35.56 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278479  normal  0.891983 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  35.9 
 
 
449 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  34.68 
 
 
428 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  37.08 
 
 
453 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  35.36 
 
 
461 aa  229  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  34.52 
 
 
454 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  35.48 
 
 
447 aa  227  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  36.12 
 
 
450 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4149  major facilitator transporter  35.92 
 
 
453 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0152976  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4217  major facilitator transporter  35.92 
 
 
453 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 
433 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  32.16 
 
 
438 aa  222  9e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3214  4-hydroxybenzoate transporter  35.36 
 
 
451 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3229  4-hydroxybenzoate transporter  35.36 
 
 
451 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1885  major facilitator transporter  35.45 
 
 
453 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  34.81 
 
 
448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1922  4-hydroxybenzoate transporter  35.36 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2687  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  35.36 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2057  4-hydroxyphenylacetate transporter, putative  35.36 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0855  putative 4-hydroxyphenylacetate transporter  35.36 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
444 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0913  general substrate transporter  35 
 
 
465 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  34.42 
 
 
454 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3175  4-hydroxybenzoate transporter  35.36 
 
 
451 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  34.81 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20360  major facilitator superfamily (MFS) permease  36.76 
 
 
432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01667  4-hydroxybenzoate transporter  34.6 
 
 
458 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42633  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0937  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
448 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.699917  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2095  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 
447 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4438  major facilitator transporter  34.74 
 
 
453 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456474  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  33.18 
 
 
455 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0354  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.57 
 
 
465 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000650677  hitchhiker  0.00000770433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0051  4-hydroxybenzoate transporter  34.69 
 
 
452 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  35.19 
 
 
448 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  33.26 
 
 
451 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1821  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 
448 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.450146  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  33.89 
 
 
468 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  31.84 
 
 
449 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  34.6 
 
 
445 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5027  major facilitator transporter  34.12 
 
 
457 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1396  4-hydroxybenzoate transporter  35.53 
 
 
579 aa  206  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  31.53 
 
 
459 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.201063 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6040  major facilitator transporter  33.26 
 
 
449 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  normal  0.189475 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  35.47 
 
 
460 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.990266 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  35.47 
 
 
460 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 
451 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>