More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1088 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  49.14 
 
 
819 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  49.72 
 
 
728 aa  689    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  47.52 
 
 
728 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  48.86 
 
 
805 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  49.21 
 
 
809 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  84.94 
 
 
726 aa  1268    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  84.94 
 
 
772 aa  1275    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  48.03 
 
 
729 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  47.12 
 
 
761 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  84.94 
 
 
772 aa  1275    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
737 aa  1482    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  41.66 
 
 
768 aa  561  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  41.66 
 
 
763 aa  561  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  42.72 
 
 
720 aa  557  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  42.08 
 
 
759 aa  555  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  43.04 
 
 
734 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  43.81 
 
 
730 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  43.37 
 
 
729 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  42.62 
 
 
753 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  40.54 
 
 
737 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  39.42 
 
 
728 aa  500  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  41.24 
 
 
724 aa  495  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  39.05 
 
 
755 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  41.7 
 
 
804 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  40.32 
 
 
746 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  41.05 
 
 
804 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  41.36 
 
 
768 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  39.17 
 
 
801 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  39.32 
 
 
801 aa  479  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  40.46 
 
 
823 aa  479  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  40.72 
 
 
722 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  39.79 
 
 
800 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  39.49 
 
 
802 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  39.92 
 
 
744 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  39.23 
 
 
754 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  39.23 
 
 
808 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  40.8 
 
 
709 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  38.14 
 
 
777 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  37.75 
 
 
758 aa  428  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  37.54 
 
 
764 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  38.78 
 
 
804 aa  426  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  38.21 
 
 
749 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  39.53 
 
 
773 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  36.68 
 
 
756 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  36.18 
 
 
771 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  36.61 
 
 
761 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  37.89 
 
 
762 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  36.24 
 
 
753 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  37.03 
 
 
700 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  36.04 
 
 
722 aa  415  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  38.49 
 
 
770 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  37.25 
 
 
725 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  36.74 
 
 
729 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  37.29 
 
 
851 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  37.29 
 
 
839 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  36.61 
 
 
764 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  37.14 
 
 
879 aa  392  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  36.3 
 
 
731 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  37.54 
 
 
773 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  36.94 
 
 
804 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  34.79 
 
 
746 aa  382  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 
712 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  33.97 
 
 
730 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  36.59 
 
 
742 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 
728 aa  252  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29.25 
 
 
727 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 
751 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 
727 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  30.45 
 
 
743 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 
716 aa  237  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 
811 aa  234  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 
743 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 
706 aa  233  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 
811 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  28.05 
 
 
726 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 
743 aa  231  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 
743 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 
743 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  30.17 
 
 
707 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 
707 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 
707 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  29.19 
 
 
705 aa  226  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  29.59 
 
 
743 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 
738 aa  224  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  28.23 
 
 
698 aa  220  7.999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 
742 aa  214  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 
774 aa  213  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 
727 aa  212  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.7 
 
 
724 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.48 
 
 
702 aa  200  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 
708 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  28.03 
 
 
728 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 
702 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 
729 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 
730 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 
742 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  28.27 
 
 
710 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.93 
 
 
710 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  26.49 
 
 
708 aa  191  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 
757 aa  191  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>