More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0928 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
393 aa  796    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  82.41 
 
 
398 aa  679    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  88.8 
 
 
393 aa  698    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  81.16 
 
 
398 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  88.55 
 
 
393 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  88.8 
 
 
393 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  95.17 
 
 
393 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  88.8 
 
 
393 aa  698    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  88.8 
 
 
393 aa  717    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  80.65 
 
 
398 aa  667    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  88.8 
 
 
393 aa  698    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  94.66 
 
 
393 aa  763    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  95.67 
 
 
393 aa  770    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  88.8 
 
 
393 aa  718    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  95.67 
 
 
393 aa  770    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  94.66 
 
 
393 aa  763    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  94.66 
 
 
393 aa  763    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  88.8 
 
 
393 aa  698    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  68.93 
 
 
394 aa  547  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  65.45 
 
 
404 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  65.45 
 
 
406 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  66.14 
 
 
396 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  65.88 
 
 
396 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  64.78 
 
 
417 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  55.61 
 
 
407 aa  434  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  51.72 
 
 
420 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  53.91 
 
 
406 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  55.2 
 
 
426 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  55.26 
 
 
406 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  55.2 
 
 
426 aa  398  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  51.93 
 
 
450 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  53.7 
 
 
398 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  51.23 
 
 
406 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  52.84 
 
 
402 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  51.96 
 
 
383 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  52 
 
 
416 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  46.29 
 
 
401 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  52.91 
 
 
426 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  48.59 
 
 
405 aa  359  4e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  47.19 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  48.32 
 
 
394 aa  355  5e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
395 aa  352  8e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
395 aa  349  5e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
395 aa  347  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  50.39 
 
 
395 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
395 aa  346  4e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  41.43 
 
 
396 aa  345  8.999999999999999e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  43.48 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  47.03 
 
 
388 aa  343  4e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  43.99 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  47.37 
 
 
377 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
397 aa  322  5e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
403 aa  322  9.999999999999999e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  41.41 
 
 
400 aa  321  9.999999999999999e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  41.13 
 
 
395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  41.82 
 
 
400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  50.26 
 
 
400 aa  318  7e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
393 aa  316  4e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  41.18 
 
 
397 aa  315  8e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 
399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  41.44 
 
 
405 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  42.75 
 
 
410 aa  309  6.999999999999999e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  42.75 
 
 
410 aa  308  8e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
340 aa  308  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  40.16 
 
 
386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  42.14 
 
 
410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  43.97 
 
 
404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 
408 aa  305  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  39.64 
 
 
433 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  41.37 
 
 
395 aa  302  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  41.52 
 
 
400 aa  301  9e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
414 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  40.59 
 
 
406 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  46.7 
 
 
402 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  41.37 
 
 
395 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
398 aa  298  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  40.51 
 
 
399 aa  297  2e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
399 aa  297  2e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  39.85 
 
 
463 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  39.59 
 
 
437 aa  295  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
398 aa  295  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
413 aa  293  3e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  37.91 
 
 
435 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  41.07 
 
 
397 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  37.84 
 
 
446 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  40.31 
 
 
395 aa  289  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  43.61 
 
 
411 aa  289  7e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  44.73 
 
 
397 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 
409 aa  286  4e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  41.58 
 
 
402 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  41.58 
 
 
402 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
392 aa  286  5e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  38.99 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 
404 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  38.38 
 
 
401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  38.42 
 
 
440 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
416 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  37.22 
 
 
438 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  37.93 
 
 
433 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>