More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0798 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3143  inner-membrane translocator  88.17 
 
 
389 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00426099  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  92.29 
 
 
389 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  92.29 
 
 
389 aa  734    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0667832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  96.92 
 
 
389 aa  771    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1972  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  92.29 
 
 
389 aa  734    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00171417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  92.29 
 
 
389 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  93.32 
 
 
389 aa  752    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  100 
 
 
389 aa  783    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0786  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  91.77 
 
 
389 aa  728    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  92.03 
 
 
389 aa  733    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0823  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  87.63 
 
 
389 aa  698    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.196198  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  95.37 
 
 
389 aa  761    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  92.29 
 
 
389 aa  734    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  92.29 
 
 
389 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  96.92 
 
 
389 aa  771    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6113  inner-membrane translocator  91.1 
 
 
389 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  94.6 
 
 
389 aa  756    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  88.17 
 
 
389 aa  705    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  96.92 
 
 
389 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4756  inner-membrane translocator  87.4 
 
 
389 aa  699    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6413  inner-membrane translocator  77.89 
 
 
389 aa  622  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2865  inner-membrane translocator  67.45 
 
 
384 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.267921  normal  0.620309 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2439  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  68.38 
 
 
378 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2707  inner-membrane translocator  71.8 
 
 
375 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990048  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2317  inner-membrane translocator  71.8 
 
 
375 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.156371  hitchhiker  0.00287138 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2727  inner-membrane translocator  67.65 
 
 
385 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1728  inner-membrane translocator  69.73 
 
 
363 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2711  inner-membrane translocator  65.77 
 
 
358 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3363  inner-membrane translocator  65.47 
 
 
358 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1289  inner-membrane translocator  60.28 
 
 
399 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1876  inner-membrane translocator  62.39 
 
 
358 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.255765  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2104  inner-membrane translocator  59.72 
 
 
398 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  64.79 
 
 
353 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5353  inner-membrane translocator  62.29 
 
 
359 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3171  inner-membrane translocator  58.33 
 
 
363 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2550  inner-membrane translocator  68.41 
 
 
370 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3207  inner-membrane translocator  63.29 
 
 
370 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.517892  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3000  inner-membrane translocator  65.86 
 
 
358 aa  410  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.463363  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1124  putative transport system permease protein  62.32 
 
 
368 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101102  normal  0.0627537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3795  inner-membrane translocator  62.91 
 
 
361 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2473  inner-membrane translocator  55.88 
 
 
373 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0760  inner-membrane translocator  60.55 
 
 
361 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000323795 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1113  inner-membrane translocator  44.62 
 
 
460 aa  259  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  42.19 
 
 
454 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  43.64 
 
 
443 aa  258  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  44.32 
 
 
452 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1861  inner-membrane translocator  47.49 
 
 
449 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.308242  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1724  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.14 
 
 
459 aa  256  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1790  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.33 
 
 
459 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0587  inner-membrane translocator  43.6 
 
 
398 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.43 
 
 
423 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1894  inner-membrane translocator  42.71 
 
 
454 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.0546266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4333  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.03 
 
 
412 aa  249  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.546398  normal  0.109331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2494  inner-membrane translocator  45.67 
 
 
463 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0791512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3514  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  43.54 
 
 
463 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.92 
 
 
418 aa  246  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3327  inner-membrane translocator  45.87 
 
 
463 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.630335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  42.32 
 
 
407 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4110  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.77 
 
 
421 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.015431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3847  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.9 
 
 
421 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0194014  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  46.01 
 
 
418 aa  241  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.28 
 
 
427 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.28 
 
 
423 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  44.6 
 
 
463 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.28 
 
 
427 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2030  inner-membrane translocator  43.6 
 
 
385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.710077  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3071  inner-membrane translocator  45.43 
 
 
463 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730301  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4278  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.51 
 
 
418 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264378  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  44.31 
 
 
415 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1139  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.51 
 
 
418 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.229928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1173  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  41.51 
 
 
418 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.556835  normal  0.907427 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2396  inner-membrane translocator  44.91 
 
 
461 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00825655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2652  inner-membrane translocator  44.35 
 
 
477 aa  236  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000103128  hitchhiker  0.00512558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  43.52 
 
 
372 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1156  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  40.97 
 
 
418 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652627  normal  0.0268072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  44.34 
 
 
321 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5270  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.87 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3350  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.87 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5017  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.87 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  43.99 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1746  inner-membrane translocator  42.29 
 
 
474 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4430  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.57 
 
 
423 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.460917  hitchhiker  0.00013336 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4945  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.57 
 
 
423 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.487918  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0653  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  44.57 
 
 
423 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3375  inner-membrane translocator  43.39 
 
 
390 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0104917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3324  inner-membrane translocator  47.48 
 
 
484 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0986477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5436  inner-membrane translocator  46.18 
 
 
475 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1084  inner-membrane translocator  43.63 
 
 
435 aa  229  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0450701  normal  0.660313 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.3 
 
 
428 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2250  inner-membrane translocator  42.03 
 
 
464 aa  229  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.571474  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.3 
 
 
428 aa  229  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  39.26 
 
 
407 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0343  inner-membrane translocator  44.67 
 
 
470 aa  228  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2317  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.75 
 
 
425 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.433018  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3572  inner-membrane translocator  42.77 
 
 
381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0134037 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3625  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  45.16 
 
 
423 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2082  inner-membrane translocator  44.19 
 
 
456 aa  225  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2843  inner-membrane translocator  40.96 
 
 
391 aa  225  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123701  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3901  inner-membrane translocator  47.43 
 
 
505 aa  225  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3337  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  43.56 
 
 
423 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>