More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0758 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0546  diguanylate phosphodiesterase  80.61 
 
 		 424 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49841  normal  0.628054 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2261  EAL domain-containing protein  86.32 
 
 		 424 aa  732    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.807134  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2455  diguanylate phosphodiesterase  95.28 
 
 		 424 aa  817    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463502 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1094  EAL domain-containing protein  86.32 
 
 		 424 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464012  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5868  diguanylate phosphodiesterase  94.58 
 
 		 424 aa  812    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145256  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0943  cyclic diguanylate phosphodiesterase  86.26 
 
 		 422 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2561  diguanylate phosphodiesterase  95.05 
 
 		 424 aa  820    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0195477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0751  EAL domain-containing protein  86.08 
 
 		 424 aa  732    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0778  diguanylate phosphodiesterase  82.74 
 
 		 436 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.263766  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0939  EAL domain-containing protein  86.26 
 
 		 422 aa  727    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.876817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0758  diguanylate phosphodiesterase  100 
 
 		 424 aa  858    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3188  diguanylate phosphodiesterase  83.02 
 
 		 436 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.338182  normal  0.117578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1925  diguanylate phosphodiesterase  94.81 
 
 		 424 aa  819    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544322  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2585  diguanylate phosphodiesterase  95.28 
 
 		 424 aa  818    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0503461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2138  cyclic diguanylate phosphodiesterase  86.26 
 
 		 422 aa  728    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0558  cyclic diguanylate phosphodiesterase  86.26 
 
 		 422 aa  728    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2537  diguanylate phosphodiesterase  94.81 
 
 		 424 aa  819    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0359  diguanylate phosphodiesterase  51.69 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.834381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2324  diguanylate phosphodiesterase  51.69 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00890506  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2960  diguanylate phosphodiesterase  51.69 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.735556  normal  0.776936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2938  diguanylate phosphodiesterase  51.69 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6290  diguanylate phosphodiesterase  51.43 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2848  diguanylate phosphodiesterase  51.43 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.423911  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2985  diguanylate phosphodiesterase  51.43 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0330  EAL domain-containing protein  50.39 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4292  diguanylate phosphodiesterase  50.13 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0415  diguanylate phosphodiesterase  49.87 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.404943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0140  diguanylate phosphodiesterase  50.38 
 
 		 424 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0380  cyclic diguanylate phosphodiesterase  49.87 
 
 		 464 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0400  cyclic diguanylate phosphodiesterase  49.87 
 
 		 464 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0565  EAL domain-containing protein  49.87 
 
 		 515 aa  359  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2792  diguanylate phosphodiesterase  35.32 
 
 		 427 aa  262  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2214  diguanylate phosphodiesterase  37.99 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.706339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2288  diguanylate phosphodiesterase  36.83 
 
 		 419 aa  252  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000327147  normal  0.604082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0993  diguanylate phosphodiesterase  34.09 
 
 		 441 aa  236  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.457608  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2662  EAL domain-containing protein  31.14 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0192  diguanylate phosphodiesterase  35.82 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2848  EAL domain-containing protein  35.15 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4326  diguanylate phosphodiesterase  35.18 
 
 		 426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0277437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1523  EAL domain-containing protein  34.49 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1389  EAL domain-containing protein  34.41 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1394  EAL domain-containing protein  35.07 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1176  diguanylate phosphodiesterase  32.84 
 
 		 411 aa  211  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0737  diguanylate phosphodiesterase  37.5 
 
 		 426 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1218  diguanylate phosphodiesterase  37.5 
 
 		 426 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.048247  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1191  diguanylate phosphodiesterase  37.25 
 
 		 447 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0738047  normal  0.284826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1744  diguanylate phosphodiesterase  34.19 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.943154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3700  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.9 
 
 		 780 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.973532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1618  diguanylate phosphodiesterase  35.25 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.991621  normal  0.575282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2035  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.75 
 
 		 790 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0244946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2834  diguanylate phosphodiesterase  34.94 
 
 		 440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1101  diguanylate phosphodiesterase  36.59 
 
 		 426 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1101  diguanylate phosphodiesterase  36.75 
 
 		 426 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2085  diguanylate phosphodiesterase  35.06 
 
 		 423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0770  diguanylate phosphodiesterase  31.36 
 
 		 414 aa  196  7e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.294803  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5831  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.17 
 
 		 777 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.36212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3887  diguanylate phosphodiesterase  32.66 
 
 		 421 aa  186  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0192627  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1766  EAL domain-containing protein  39.39 
 
 		 474 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561967  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0677  EAL domain-containing protein  39.39 
 
 		 482 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0823154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1192  EAL domain-containing protein  39.39 
 
 		 474 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.252573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1033  diguanylate phosphodiesterase  26.61 
 
 		 413 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0109  hypothetical protein  48.34 
 
 		 171 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00195405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2024  hypothetical protein  48.34 
 
 		 171 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2261  hypothetical protein  48.34 
 
 		 171 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3070  hypothetical protein  48.34 
 
 		 171 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1754  diguanylate phosphodiesterase  30.13 
 
 		 431 aa  123  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2479  diguanylate phosphodiesterase  28.54 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2032  EAL domain protein  31.08 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3003  diguanylate phosphodiesterase  27.62 
 
 		 387 aa  106  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176635 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0612  diguanylate phosphodiesterase  27.57 
 
 		 197 aa  100  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0470  hypothetical protein  31.69 
 
 		 288 aa  96.3  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129901  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0662  putative signaling protein  28.85 
 
 		 266 aa  96.3  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3972  diguanylate phosphodiesterase  26.63 
 
 		 387 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05954  hypothetical protein  31.51 
 
 		 272 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000218  diguanylate phosphodiesterase  29.2 
 
 		 272 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0220  hypothetical protein  24.31 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1154  hypothetical protein  27.48 
 
 		 603 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0220  hypothetical protein  24.31 
 
 		 360 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3527  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.45 
 
 		 581 aa  86.7  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0731  diguanylate phosphodiesterase  21.24 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0894  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.75 
 
 		 605 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.396651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0541  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.02 
 
 		 567 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2658  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.77 
 
 		 641 aa  79.7  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4345  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.61 
 
 		 572 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3319  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.86 
 
 		 584 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.777593  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2106  diguanylate phosphodiesterase  26.72 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0436  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.29 
 
 		 590 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1820  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.01 
 
 		 599 aa  77  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.07 
 
 		 632 aa  76.6  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4673  sensory box/GGDEF family protein  28.57 
 
 		 567 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.6834899999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0506  diguanylate phosphodiesterase  24.61 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0555  hypothetical protein  25.78 
 
 		 584 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.86 
 
 		 585 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136052  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3936  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.86 
 
 		 585 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.573208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.44 
 
 		 583 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0467  EAL domain protein  27.19 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0116221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0664  sensory box/GGDEF family protein  29.2 
 
 		 567 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3810  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.86 
 
 		 585 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0696  sensory box/GGDEF family protein  28.12 
 
 		 568 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.612215  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3153  putative diguanylate phosphodiesterase  27.73 
 
 		 584 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.920716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>